单细胞测序界世界杯正酣,看Takara的ICELL8如何突出重围
——大显神通篇
前言:
2018年俄罗斯世界杯赛事已过半,有的顺利晋级,有的黯然离场,只有过硬的实力才能保证笑到最后!
大家好!我叫ICELL8,来自Takara,工作是单细胞“职业猎手”,相信看过单细胞测序界世界杯开战,看Takara的ICELL8如何突出重围——奋发有为篇 的小伙伴一定对我印象深刻,我真诚的感谢各位小伙伴的支持。
上篇提到,我通过“灵巧的手(MSND)”、“锐利的眼(Imaging Station)”和“聪明的头脑(CellSelect)”捕获“活的单细胞”,这使得我俨然成为了单细胞测序界的“小能手”。但是,“奋发有为”如我,积极修炼单细胞应用“心法”,最终是要从 “小能手”晋级到 “大师”的。
「修炼心法,稳扎稳打」
为了处于业界“不败之地”,我在5-100 μm范围的细胞内挑选“活的单细胞”用于“心法”修炼。
先修炼——3’末端mRNA差异表达分析“心法”(点击了解)
有了Takara SMART-Seq单细胞RNA文库构建技术加持,对各种细胞都能获得优异的mRNA 3’端差异表达分析结果。如对iPS细胞向心肌细胞分化的四个时间点进行分析,结果准确显示不同分化阶段存在基因表达差异。
图1 iPS向心肌细胞分化示意图
图2 tSNE基因表达差异解析结果
图3 弦图展示两种细胞TCRβ克隆型分配情况
图4 SMART-Seq技术允许即使较低测序深度,也能获得大量的转录本和基因
图5 RNA-Seq文库体现出更高的覆盖度均一性,说明分析结果无3’或5’偏好性,
对研究剪切异构体等深度分析尤为重要
图6 更为完整的信息, 数据更丰富,支持如BCAT1可变转录本鉴定(Alternative transcripts),
9268–9672 nt, 9–11 exons
划个重点:要练就练“秘术”,要选就选“大师”。还不赶紧把ICELL8接回实验室?
文末再送一波福利
即日起至2018年8月31日来信咨询ICELL8的小伙伴,将获得Takara精美实用的酒精喷壶一个,先到先得哦
来信咨询:guoz@takarabiomed.com.cn
大家在关注世界杯的同时,也要关注ICELL8哈
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