IPA(Ingenuity Pathway Anaylsis)是目前生命科学研究领域最可靠，最全面的功能研究利器。基于后台高度结构化的Ingenuity Knowledge Base，包括人工阅读提取的几百万条公开发表的科研成果和报告，IPA的数据分析和搜索能力可以帮助您了解您所获得的数据、特定的靶标或者候选生物标志物在庞大的生物化学体系中重要性。

IPA的引用量逐年上升，已经在生命科学研究的各个领域应用：

IPA分析软件的特点：

1. 数据库的完整性与广泛性
Ingenuity® Knowledge Base数据库是构成所有Ingenuity产品的核心技术。它是一个由生物相互作用和功能注释信息构成的数据库，包含数以百万计的独立建模的proteins, genes, complexes, cells, tissues, drugs和disease间相互关系，是目前国际上独一无二的。

2. 分析结果基于实验结果支持
它包括来自广泛的生物医学出版文献，IPA科学家总结的知识，以及各种值得信赖的第三方来源数据和数据库的信息，这样就可以轻松地把多种信息整合在一起。

IPA主要分析内容：

1） Canonical pathways analysis   

图1  pathway差异显著性和激活抑制情况柱形图 

 2） Diseases and Bio Functions

图2 Diseases和Bio Functions总体分布块状图

3） 基因的信号通路网络图 

图3 基因表达与调控信号通路网络图

4）上游调控分析

 图4 上游调控因子EOME1与下游调控关系网络图

5） 调控机制分析

IPA运用案例：

研究背景

类风湿性关节炎（RA）和二型糖尿病（T2D）都是非常复杂且慢性的系统性疾病。这两种病都显著增加了患上心血管疾病（CVD）的风险，对患者的身体健康造成严重的困扰。

该研究通过对RA和T2D患者的测序数据用IPA软件进行分析和比较，深入研究了RA和T2D之间的内在关联。

IPA  singnaling pathways 和bio-function分析结果  

IPA  upstream regulators network分析