DNA甲基化在基因表达调控中扮演了关键角色。Illumina基于 Infinium和 GoldenGate两种平台,相应推出了人类全基因组甲基化芯片,GoldenGate甲基化肿瘤芯片。
• Infinium HumanMethylation27 BeadChip
采用Infinium技术方案,每张芯片可检测12个样本。每个样本可检测>27,000个CpG位点。覆盖约13,000个有明确注释的基因(NCBI CCDS Database1,Genome Build 36),超过1000个肿瘤相关基因,200个miRNA基因启动子,150个已知的甲基化状态具有组织特异性的DNA区段。
• 450K Infinium Methylation BeadChip (NEW!)
该芯片设计了450,000多个甲基化位点,全面覆盖了96%的CpG岛,并根据需求加入了CpG岛以外的CpG位点、人类干细胞非CpG甲基化位点、正常组织与肿瘤(多种癌症)组织差异甲基化位点、编码区以外的CpG岛、miRNA启动子区域和已通过GWAS的疾病相关区域的位点,同时覆盖了HumanMethylation27 BeadChip的90%的位点。每张芯片可平行进行12个样本的检测。集合了全面、高样品通量,以及价格实惠等优点。
• oldenGate Methylation Cancer Panel I
采用GoldenGate技术方案,包含了807个肿瘤相关基因的1,505 CpG 岛。71.4%的基因拥有2个或2个以上的CpG位点。 |