从m6A-IP、建库测序分析及MeRIP-qPCR一站式服务
高成功率的ng级建库
一网打尽mRNA、长链非编码RNA
RNA修饰对表观转录调控过程十分重要,目前已知过百种RNA修饰,主要是RNA甲基化。N6-甲基腺嘌呤(N6-methyladenosine,m6A)作为最常见的一种转录后修饰,在真核生物中高度保守,介导了超过半数的RNA甲基化。m6A修饰普遍存在于mRNA 和多种类型的非编码RNA,通过影响RNA加工成熟、稳定性、mRNA运输与翻译、RNA编辑等方面,参与肿瘤发生和转移、胚胎发育、DNA损伤修复和病毒感染等生物学功能和作用机制的研究。
锐博生物提供的MeRIP-Seq(Methylated RNA Immunoprecipitation Sequencing)利用单克隆抗体抓取存在m6A修饰
的RNA片段,结合高通量测序,实现转录组学范围内的m6A peak检测与motif分析,欢迎登陆www.ribobio.com委托技术服务。 |
锐博优势技术特色
平台完整: MeRIP实验—建库测序分析—MeRIP qPCR验证,真正一站式服务
高成功率:成功开展超过1000例样本,支持低至ng级别RNA建库
灵活选择:建库方式和文库片段大小可选
重复性好:丰富的项目经验确保实验重复性,已进行多样本间的比较分析
项目样品准备
组织:建议>3g,部分RNA量少的组织可能需更多的组织。
细胞:建议> 2×107,部分RNA量少的细胞可能需更多的细胞。
total RNA:建议>100 μg。 |
推荐测序模式及数据量
illumina SE50,20M clean reads
illumina PE150,6G clean data |
研究思路参考
丰富的生物信息学分析
重点标准信息分析 |
高级信息分析 |
数据的可视化
结合峰检测
结合峰注释及统计
基因表达分析
参考基因组比对
Peak 富集度和基因表达相关性分析
结合峰motif 检测
差异结合峰分析
目的基因GO 和KEGG 分析 |
基因表达差异分析
m6A 位点的预测
m6A 与疾病的相关性
与其他数据关联分析 |
详细的结题报告模板、研究思路和相关文献,请联系锐博销售代表,欢迎您登陆www.ribobio.com委托技术服务。
代表性参考文献
1. Fu, Y., Dan, D., Rechavi, G., & He, C*. "Gene expression regulation mediated through reversible m6A RNA methylation."
Nature Reviews Genetics 15.5 (2014):293-306.
2. Roundtree, I. A., Evans, M. E., Pan, T., & He, C*. "Dynamic RNA Modifications in Gene Expression Regulation."
Cell 169.7 (2017):1187
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