表观遗传学研究之DNA甲基化 | 表观遗传学研究之miRNA

 

一、表观遗传学研究之DNA甲基化
      目前,表观遗传学已经成为一个新的研究热点,作为表观遗传学研究的一个重要方面,各类DNA甲基化研究方法不断涌现、发展。欧易技术平台针对高通量、中通量以及特定基因的甲基化检测,分别发展了不同的技术方法,助力您的研究。
DNA甲基化芯片
高分辨率溶解曲线法
亚硫酸盐测序法
三种方法技术特点比较

高通量——Illumina甲基化芯片检测发生甲基化的准确位点
      欧易技术平台采用的illuminaDNA甲基化芯片操作简单,无需进行烦琐的免疫共沉淀,直接检测到发生甲基化的准确位点;通量高,可一次性检测12份样品,每个样品最多可检测450,000个位点。

中通量——高分辨率熔解曲线法(HRM)检测DNA甲基化水平
      HRM是一种最新的遗传学分析手段,具有很高的特异性、稳定性和重复性,已经成为对未知新突变扫描、筛查疾病相关突变/SNP、等位基因频率分析、物种鉴定、DNA指纹分析、DNA甲基化分析等重要的检测手段。欧易技术平台应用HRM的检测方法,对样本的DNA甲基化程度进行快速检测。

针对感兴趣的基因——亚硫酸盐测序法发现新的甲基化位点
      针对某一特定基因上可能的甲基化位点,欧易技术平台通过亚硫酸盐处理在电泳之后对条带进行克隆测序,从而得到想要的部分片段的测序结果,通过软件分析可以知道该片段甲基化发生的确切位点,测序克隆也可以计算其发生甲基化的频率。

三种方法技术特点比较

 

Illumina

HRM

BSP

样品

新鲜组织、血液、细胞,石蜡样本等生物材料

DNA用量

500ng甲基化后的DNA

2ug未甲基化的DNA

2ug未甲基化的DNA

通量

1-12个样品/slide;每个样品可检测27k和450k个位点

1-96-384个样品;每个样品可检测几个位点

低通量,位点数少,是甲基化的金标准。

数据处理

探针注释、相关性分析、热图、与基因表达谱联合分析以及染色体搜索

特异熔解曲线

测序报告


二、表观遗传学研究之miRNA
      目前,表观遗传学已经成为一个新的研究热点,作为表观遗传学研究的一个重要方面,miRNA的研究亦是欧易技术平台关注的领域。众所周知,miRNA研究,无论筛选差异miRNA还是接下来的定量PCR验证,都存在着一定难度,这是因为miRNA具有以下特点:

  • 很小,只有20多个碱基
  • 相对保守,高度同源
  • 前体和成熟miRNA同时存在
  • 表达的动态范围很广
  • 数据库不断更新

      欧易技术平台应用Agilent miRNA先进的芯片技术平台,从容解决上述问题,帮助您准确筛选出差异miRNA。同时,欧易在miRNA的定量PCR验证方面也积累了丰富经验,为您提供进一步实验帮助。同时,欧易还提供其它研究方法,满足您多种选择。
Agilent芯片技术服务
Onearray芯片技术服务
miRNA定量PCR技术服务

Agilent miRNA芯片技术服务
      作为miRNA芯片的后起之秀,Agilent miRNA芯片自上市之初就受到业界广泛关注,上市以年来,其优异的性能指标更是获得科研工作者的广泛认可,稳占国内市场应用第一名。欧易公司应用agilent miRNA芯片技术平台,为您的科研提供服务。产品包括人miRNA芯片、小鼠miRNA芯片、大鼠miRNA芯片 芯片探针序列来源可以与Sanger miRBASE同步更新。

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平台特点:

  • Aglent独特专利的探针设计(如图),保证只识别成熟miRNA
  • 高度灵敏,可识别一个碱基差异,检测下限<0.1 amol
  • 样品需求量低,只需要100ng 总RNA
  • 不需要分离miRNA,避免丢失及引起误差
  • 宽的动态检测范围,检测丰度跨5个log,有利于检测到更宽丰度范围的miRNA
  • 高重复探针,每个miRNA至少重复20次
  • 良好的实验表现,平均CV<10%,R2﹥0.99  

OneArray® miRNA芯片技术服务

      OneArray® miRNA 芯片为台湾华联生物技术公司研发的一款miRNA芯片产品,经过多方测试比较,其性能与国际知名大厂生产的芯片结果无论精度还是检出率均相差无几,并且与其他全检测方法例如定量PCR具有很好的相关性。其芯片包含最新数据17.0版本人类miRNA芯片(Human miRNA OneArray®)和17.0版本小鼠 & 大鼠全基因体芯片(Mouse & Rat miRNA OneArray®)并提供样品检测服务及芯片数据分析等服务。欧易生物作为华联生物科技公司大陆地区的深度合作伙伴和华东区总代理,为了更好地服务大陆地区客户,我们坚持:

  • “原厂生产,原厂服务”,确保客户获得最可靠的数据
  • “DO MORE,GET MORE”,保证品质前提下,相同费用检测更多样品,获得更多数据
  • “服务本土化”,当地化的售前、售中、售后支持,第一时间满足客户

miRNA定量PCR技术(qPCR)服务

       欧易技术平台针对客户需求,采用加尾法以及茎环法两种不同实验原理,为您的芯片实验结果提供定量PCR验证,您可根据实验需要自由选择。您只需要提供保存完好的组织(包括石蜡包埋的组织)、细胞、血液、血浆或血清等标本,我们即可针对您提供的miRNA设计探针,进行实时定量PCR实验,最终提供给您完整规范的实验报告,节约您的时间和精力。
两种方法比较

加尾法

茎环法

样品用量

1μg total RNA

1μg total RNA

引物

通用反转录引物

茎环特异引物

检测通量

可同时检测数十个miRNA

客户需要了解的microRNA

产物特异性

加尾法服务特色:

  • RNA加尾和引物延伸法,样本用量少(1μg)且不需分离miRNA
  • 采用通用反转录引物,一次反转录产物可用于上百个miRNA检测
  • 检测通量高,可同时检测数十个miRNAs
  • 不同末端成熟miRNA都能被加尾和反转录,保证定量准确性
  • 配合QIAGEN试剂盒,保证实验可靠性
  • 扩增产物特异性高,通过产物热解离曲线(融解曲线)判断

茎环法检测microRNA(Taqman 探针)服务特色:

  • 高特异性——只对成熟MicroRNAs进行定量,而不受其前体干扰
  • 快速,简单——整个操作只需两步,不到3个小时,即可获得高质量的数据
  • 灵敏——样品消耗少,仅需1-10ng的total RNA或同等物 
  • 超宽的线性范围——可跨越7个数量级

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