本次Arraystar lncRNA芯片升级，新增注释如下：

序列完整性(Completeness)*: 完整的lncRNA 5’末端序列和3’末端序列对于lncRNA的后续研究至关重要，比如查找lncRNA的精确转录起始位点和启动子区域，以及CRISPR-Cas系统靶点设计等。根据序列完整程度， lncRNA分别注释为Complete 5’end、Complete 3’end 和 Full length等三类。

表观基因组信息(Epigenomic_context & DHS_context)* : lncRNAs的转录过程受到启动子或者增强子调控。启动子和增强子是经典的DNA顺式调控元件，带有各自特有的表观遗传标记。活跃的启动子或增强子自身也是转录单位，能产生有功能的非编码RNA。因此，可根据表观基因组信息（如DNase I超敏位点）将lncRNA分为启动子-lncRNA（p-lncRNA）和增强子-lncRNA（e-lncRNA）。其中，根据基因组结构，可将p-lncRNA进一步细分为intergenic p-lncRNA和divergent p-lncRNA。p-lncRNA的表达常和该启动子调控的蛋白编码基因的转录水平存在正相关关系； 而e-lncRNA则可以捕获转录因子到转录位点、调节染色体结构、组织形成细胞核三维拓扑结构域等，从而调控靶基因的转录。

亚细胞定位**  lncRNA的分子功能与其所在的亚细胞位置密切相关。比如，位于细胞核或染色体上的lncRNA常通过影响表观遗传修饰和转录过程来调控基因表达。细胞质中的lncRNA则更可能参与翻译调控或通过吸附miRNA来发挥ceRNA功能。

短肽编码潜能*  虽然大部分lncRNA不具备蛋白编码功能，但有些lncRNA含有小的开放阅读框（smORFs），具备编码短肽的能力。芯片注释包含了LncRNAWiki数据库中预测或实验验证过的短肽编码信息。

miRNA识别位点  预测或经实验验证的miRNA识别位点可以很好地帮助客户寻找lncRNA在miRNA调控网络中的潜在调节功能，如作为ceRNA发挥作用。