Twist FlexPrep™ UHT文库制备试剂盒为人群大队列研究、农业基因组学和其他超高通量应用提供了一种替代基因芯片的 NGS 解决方案。通过将Twist的Normalization by Ligation (NBL) 技术与金标准酶切法片段化相结合,Twist FlexPrep™ UHT 文库制备试剂盒为不同DNA 起始量样本提供了内置的样本归一化能力,降低了文库制备样本前处理的成本和复杂性。样本条形码技术还可以将 12 个样本合并到一个反应中,让工作流程更加精简和高效。
产品优点
Normalization by Ligation (NBL)
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前期混样可节省成本
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专为超高通量混样建库而设计
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化繁为简,集成归一化
Twist FlexPrep™ UHT 文库制备试剂盒采用了创新的连接归一化(Normalization by Ligation™)方法,无需进行前期和中间的样本定量操作,从而简化了您的测序工作流程。
简化流程,高效经济
片段化和连接反应在每个样本对应的单个孔中进行。连接过程中使用的接头包含内嵌条形码,这使得 96 孔板中同一排的 12 个孔的样本都能合并在一起。通过聚合酶链式反应(PCR)为各个样本池添加唯一双索引(UDIs),以便在样本池层面进行解复用。使用一套 FlexPrep 试剂盒,单次测序运行最多可处理 1152 个样本,从而将测序通量最大化。这种效率的提升能够转化为成本的降低和耗材的节省。
FlexPrep UHT 的归一化产量 *
在不同 DNA 起始量输入情况下的新一代测序(NGS)读数深度归一化。在对唯一双索引和内嵌条形码进行解复用后,计算分配至每个文库的总读数占比。理想归一化情况下的平均值预计为 1.04%(100/96)。
目标区域的可调覆盖度 *
FlexPrep UHT 可生成高复杂性的文库,在进行靶向富集后能实现均匀的覆盖度。搭配 Twist 定制Panel,FlexPrep能够对单核苷酸多态性(SNP)、k 聚体、结构变异以及其他感兴趣的基因组区域实现可调的覆盖度。对富集后的样本材料进行下采样,使其平均覆盖度达到 75 倍。相关关键靶向富集指标由 Picard 软件进行报告。
Target Enrichment using a 96-plex30 ng to 300 ng gDNA Mass Input into Library Preparation |
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Metrics at 75x Raw Target Coverage |
Average +/- Standard Deviation |
Selected BasesMean Target CoverageChimerasFold-80 Base PenaltyCovered Bases at 10XCovered Bases at 20XCovered Bases at 0X |
79.22% +/- 0.54%32.74 +/- 4.781.31% +/- 0.38%1.416 +/- 0.04496.06% +/- 0.94%85.41% +/- 6.36%0.43% +/- 0.04% |
* 使用方法:使用 Twist FlexPrep UHT 文库制备试剂盒和 FlexPrep 靶向富集方案,以人类基因组 DNA(gDNA)(NA12878)制备 96 个文库,采用定制的 800kb 检测面板进行 96 重检测,然后在 Illumina NextSeq 550 上进行测序。每个文库池使用 30ng 至 300ng 不等的起始量,生成 8 个文库池,每个文库池包含 12 个样本。** 基于酶切片段化、连接和 PCR 工作流程的标准试剂盒 *** 所有图表、图示和图形均基于 Twist 2024 年 9 月的内部数据。仅供科研使用。不可用于任何诊断或临床程序。
仅供研究使用。不适用于诊断程序。
*基于 8 孔与 96 孔工作流程
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