探寻免疫治疗奥秘:DNAH 基因与基因表达特征助力黑色素瘤精准诊疗

【字体: 时间:2025年04月25日 来源:Journal of Translational Medicine 6.1

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  免疫检查点抑制剂(ICIs)治疗黑色素瘤时,存在耐药及预测生物标志物不足等问题。研究人员分析 342 例黑色素瘤患者的基因组和转录组数据,发现 DNAH 基因突变及相关基因表达特征与 ICIs 疗效和生存相关,为个性化治疗提供依据。

  
黑色素瘤,这个隐藏在皮肤深处的 “杀手”,近年来愈发猖獗。随着人们生活方式的改变,紫外线暴露增多、美黑行为流行,它的发病率如同坐上了 “火箭”,一路飙升。在过去,黑色素瘤的治疗手段十分有限,患者往往陷入绝望的深渊。但免疫检查点抑制剂(ICIs)的出现,宛如一道曙光,为晚期黑色素瘤患者带来了新的希望。像帕博利珠单抗(pembrolizumab)、纳武利尤单抗(nivolumab)等药物,显著提高了患者的生存率。

然而,这道曙光并未照亮所有患者。近 50% 的黑色素瘤患者在接受 ICIs 治疗后会产生耐药性,而且治疗过程中还会出现免疫相关不良反应(irAEs)。此外,由于缺乏有效的预测和预后生物标志物,医生难以根据患者的具体情况制定个性化的治疗方案,导致治疗效果参差不齐。在这样的背景下,探寻更精准有效的治疗策略迫在眉睫。

为了攻克这些难题,来自中国人民解放军总医院、北大荒集团总医院等多家机构的研究人员,踏上了探索之旅。他们深入剖析黑色素瘤患者的肿瘤样本,试图找到隐藏在其中的奥秘。最终,他们的研究成果发表在了《Journal of Translational Medicine》上,为黑色素瘤的治疗开辟了新的道路。

研究人员开展了一项多队列研究,整合了临床、基因组和转录组数据。他们从公开数据库中获取了 4 个独立队列的黑色素瘤患者数据,这些患者均接受了 ICIs 治疗。在这个庞大的数据集里,研究人员运用了全外显子测序(WES)和全转录组测序(WTS)技术。WES 能够检测基因组中所有外显子区域的变异,而 WTS 则可以分析基因的表达情况,通过这两种技术,研究人员全面地了解了肿瘤的基因特征。

在患者特征方面,研究发现男性患者数量接近女性患者的两倍,大部分患者处于转移性疾病阶段。而且,接受抗 PD - 1 治疗的患者临床反应更好,其肿瘤的突变负荷也更高。

通过对基因组的深入分析,研究人员发现了一些与 ICIs 反应相关的基因。在众多突变基因中,动力蛋白轴丝重链(dynein axonemal heavy chain,DNAH)家族基因的突变引起了他们的注意。DNAH2 、DNAH6 和 DNAH9 这三个基因在反应者中突变频率更高。携带这些基因突变的肿瘤患者,无进展生存期(PFS)和总生存期(OS)都显著延长。研究人员进一步在非小细胞肺癌(NSCLC)队列中进行验证,发现 DNAH6 突变及 DNAH 2/6/9 改变同样与更好的预后相关。这表明 DNAH 基因突变有望成为预测 ICIs 疗效和患者生存的重要生物标志物。

为了探究 DNAH 基因突变影响 ICIs 疗效的内在机制,研究人员比较了 DNAH 突变和未突变肿瘤的基因表达谱。他们发现,DNAH 突变的黑色素瘤中,趋化因子信号通路、细胞因子 - 细胞因子受体相互作用等免疫相关通路显著富集。同时,免疫细胞浸润分析显示,这类肿瘤中单核细胞和静息树突状细胞的比例更高,这意味着肿瘤微环境(TME)的免疫活性更强,更有利于免疫系统识别和攻击肿瘤细胞。

在寻找预测 ICIs 临床反应和长期生存的转录组特征时,研究人员通过对比反应者和非反应者的基因表达谱,筛选出了一系列差异表达基因。经过进一步的分析和建模,他们得到了一个由 26 个基因组成的复合特征,能够较好地预测临床反应;还确定了 13 个与总生存期相关的基因,可用于评估患者的预后风险。

总的来说,这项研究意义重大。研究人员发现的 DNAH 基因突变和相关基因表达特征,为黑色素瘤患者 ICIs 治疗的疗效预测和预后评估提供了新的生物标志物。这有助于医生在治疗前更准确地判断患者对 ICIs 的反应,为患者制定更个性化的治疗方案,提高治疗效果。然而,研究也存在一些局限性,比如验证水平有待提高,不同分子水平的特征整合不足等。未来,还需要更多的研究来进一步完善这些发现,将这些生物标志物真正应用到临床实践中,让更多的黑色素瘤患者受益。

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