单细胞分辨率下病毒序列检测：发现与宿主基因表达变化相关的新型病毒，开启病毒研究新视野

当前高通量测序在多领域广泛应用，但现有测序数据中病毒识别方法存在局限。研究人员开展了基于高度保守的 RdRP 蛋白检测病毒序列的研究，能在单细胞分辨率下并行分析病毒存在与宿主基因表达，发现新病毒并预测细胞中病毒存在，意义重大。

　　高通量测序方法在研究、农业和医疗保健领域的应用越来越广泛，这为经济高效地监测病毒多样性以及探究病毒与疾病的相关性提供了契机。然而，现有的在测序数据中识别病毒的方法依赖于参考基因组且受其限制，或者无法通过细胞条形码追踪来保留单细胞分辨率。有一种新方法，它基于高度保守的 RNA 依赖性 RNA 聚合酶（RdRP）蛋白，能够在批量和单细胞转录组学数据中准确快速地检测病毒序列，可检测超过 100,000 种 RNA 病毒。在单细胞分辨率下同时分析病毒的存在情况和宿主基因的表达，有助于描绘宿主病毒组特征，识别病毒嗜性和宿主反应。将该方法应用于感染埃博拉病毒病的恒河猴外周血单个核细胞数据时，发现了此前未知的潜在病毒。此外，还能根据恒河猴的基因表达准确预测单个细胞中病毒的存在情况。