杨树应对盐胁迫的动态调控机制研究:挖掘关键基因与调控网络,助力抗逆育种

【字体: 时间:2025年04月19日 来源:Trees 2.1

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  为解决杨树受盐胁迫影响的问题,研究人员通过时间进程转录组深入研究杨树(Populus davidiana×P. alba)根对盐胁迫的响应。发现不同阶段有不同关键基因,构建了以 PdaHsp20s 为底层基因的调控网络,为揭示杨树盐胁迫响应机制提供新视角。

  杨树(Populus davidiana×P. alba)是中国广泛种植的优良树种,但深受盐胁迫影响。本研究借助时间进程转录组技术,深度剖析杨树根部对盐胁迫的响应,在不同时间点识别出大量差异表达基因(DEGs)。经加权基因共表达网络分析(WGCNA)发现,在盐胁迫早期(3 - 6 小时),氧化和渗透胁迫调节在抵抗盐胁迫中起关键作用,氮代谢和转运基因是枢纽基因;盐胁迫中期(12 - 24 小时),植物启动广泛重编程以适应胁迫,转录因子(TFs)WRKY53、MYB13 和 NFXL1 成为枢纽基因;盐胁迫 48 小时后,7 个 PdaHsp20 基因成为枢纽基因,可能减轻盐胁迫伤害。对 Hsp20s 进行全基因组分析,发现 Hsp20 蛋白可分为 11 组。构建了以 PdaHsp20s 为底层基因的三层基因调控网络,通过与共表达网络关联分析找到独特的 PdaERF72,其可能在盐胁迫下调控 PdaHsp20s 发挥重要作用。对 PdaERF72 及与其直接相连的 PdaHsp20s 的表达水平分析表明,盐胁迫后部分基因间可能存在负调控关系。总之,杨树能动态响应盐胁迫,不同枢纽基因在不同胁迫阶段发挥作用,为揭示杨树应对盐胁迫的机制提供了新视角。
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