综述：利用基于NGS的方法解析檀香微生物组及其相互作用以改进农林管理实践

《Symbiosis》：Unravelling the sandalwood microbiome and their interactions using NGS-based approaches to improve agroforestry management practices

这篇综述系统梳理了印度檀香（Santalum album L.）相关微生物组（包括根际和内生菌群）的研究进展，探讨了其半寄生特性与病害易感性对农林管理的挑战。作者通过分析高通量测序（NGS）技术在微生物多样性、功能解析及气候适应性中的作用，提出微生物互作可优化檀香保育策略、提升生态系统韧性，并为可持续农林实践提供科学依据。

　　

??檀香微生物组：从基础研究到农林应用??

??微生物组与檀香的共生互作??
檀香（Santalum album L.）作为半寄生树种，其生长依赖宿主植物的养分吸收，而根际和内生微生物组（microbiome）在此过程中扮演关键角色。研究表明，檀香根际富含固氮菌（如Rhizobium spp.）和丛枝菌根真菌（AMF），这些微生物通过促进氮磷循环直接增强宿主营养获取。内生菌（如芽孢杆菌Bacillus和链霉菌Streptomyces）则通过合成抗菌代谢物（如几丁质酶）抑制病原菌（如Fusarium oxysporum），降低病害风险。

??NGS技术驱动的微生物组解析??
高通量测序（NGS）技术（如16S rRNA和ITS测序）揭示了檀香微生物组的高度多样性。宏基因组学（metagenomics）进一步解析了功能基因（如nifH固氮基因），而转录组学（RNA-seq）则显示微生物群落动态响应干旱胁迫，上调应激相关通路（如ROS清除基因）。这些数据为设计微生物辅助育种（MAB）策略提供了分子基础。

??微生物组在农林管理中的潜力??
檀香微生物组的应用可优化现有农林系统：1）接种AMF提升幼苗存活率；2）利用拮抗菌（如Pseudomonas fluorescens）开发生物农药；3）通过微生物群落监测评估林地健康。此外，微生物组驱动的生态恢复（如退化土壤修复）可增强檀香对气候变化的适应性（如高温耐受性）。

??挑战与未来方向??
当前研究存在样本量局限（如仅聚焦印度特定产区）和功能验证不足（如缺乏无菌体系实验）等缺口。未来需整合多组学（multi-omics）和合成微生物群落（SynComs）技术，推动从实验室到田间的转化研究，最终实现檀香资源的可持续管理。

??结论??
檀香微生物组研究为半寄生树种的农林管理提供了革新视角。通过NGS技术与生态理论的结合，可精准调控微生物互作网络，平衡经济产出与生态保护，助力全球檀香产业的绿色发展。