地中海海绵真菌组随机定植模式揭示海洋真菌生态学新认知

【字体: 时间:2025年04月11日 来源:Microbial Ecology 3.3

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  编辑推荐:本研究针对海洋海绵共附生真菌群落(mycobiome)结构不清的科学问题,采用ITS1标记的宏条形码技术,首次揭示地中海四种海绵(Petrosia ficiformis/Chondrosia reniformis/Crambe crambe/Chondrilla nucula)真菌组呈现高种内变异性和随机定植特征,核心菌群缺失现象挑战了传统共生理论,为理解海洋真菌生态功能提供新视角。

  

在地球表面71%的海洋中,海绵作为最古老的多细胞动物之一,长期被视为"微生物的豪华公寓"。这些滤食性生物不仅构建了复杂的原核生物共生网络,更在碳氮硫循环中扮演关键角色。然而,与细菌和古菌研究的热度形成鲜明对比的是,海绵共附生真菌——这群神秘的"海洋房客"始终蒙着面纱。传统观点认为,像高微生物丰度(HMA)和低微生物丰度(LMA)海绵这样的宿主会像筛选珍珠般精心选择其微生物伙伴,但真菌是否遵循同样的规则?这个问题的答案,关乎我们能否完整理解海洋生态系统的运作密码。

意大利国家生物多样性未来中心(NBFC)联合斯塔齐奥内动物研究所的研究团队在《Microbial Ecology》发表突破性成果。通过分析地中海四种生态特征迥异的海绵(包含HMA和LMA物种),研究者发现Aspergillus、Cladosporium等优势真菌属虽广泛存在,但群落结构呈现"抽签式"随机分布,彻底颠覆了微生物共生必然具有宿主特异性的传统认知。这项研究如同打开潘多拉魔盒,展现出海洋真菌生态远比想象中复杂多变的图景。

研究团队采用多学科交叉方法展开探索:首先在意大利伊斯基亚岛采集四种海绵及周边海水样本,通过肽核酸(PNA)介导的PCR clamping技术抑制宿主DNA干扰;随后利用ITS1标记进行高通量测序,结合UNITE数据库和自定义海绵序列库进行生物信息学分析;最后通过α/β多样性指数、SIMPER相似性分析和共现网络等生态统计学方法,系统解析真菌群落结构特征。

在"Alpha and Beta Diversity of Fungal Communities"部分,研究数据呈现出令人惊讶的波动性:单个海绵样本的真菌ASV(扩增子序列变异)数量从2到73不等,且Shannon多样性指数在种内差异高达6倍。主坐标分析(PCoA)显示样本点呈"星空状"分散分布,PERMANOVA检验证实群落结构无显著宿主特异性。这种"各自为政"的分布模式,与细菌群落的稳定结构形成鲜明对比。

"Composition of the Sponges' Associated Mycobiome"揭示了更微观的图景:虽然鉴定出204个真菌属,但超过50%的ASV无法准确分类。四大优势属(Aspergillus、Cladosporium、Malassezia、Penicillium)的相对丰度呈现剧烈波动(如Cladosporium在C. nucula中占比1-93%)。SIMPER分析显示种内相似性不足6%,而种间差异超90%,暗示真菌与海绵的"同居关系"可能仅是环境过滤的偶然结果。

讨论部分提出了颠覆性解释:真菌群落的随机性可能源于其独特的传播策略。与细菌不同,真菌更倾向"机会主义"的horizontal acquisition(水平获取)而非vertical transmission(垂直传递)。特别值得注意的是,具有光共生特征的C. nucula虽携带独特酵母属(Schizosaccaromyces/Wickerhamomyces),但这可能仅是演化长河中的偶然浪花。研究同时指出当前海洋真菌数据库的严重缺陷——68%的ASV无法注释,这如同在黑暗森林中探索,每步都可能遇见未知生命形式。

这项研究的意义远超学术范畴:它首次用大数据证明海绵真菌组遵循"生态彩票"理论,这种随机性可能赋予宿主应对环境突变的缓冲能力。就像金融投资组合分散风险,多样化的"真菌房客"或许为海绵提供了代谢功能冗余。该成果为理解气候变化下海洋共生系统的稳定性提供新框架,同时暴露出海洋真菌分类学的巨大空白——当我们连"居民名单"都未掌握时,又如何理解它们的"社区规则"?这项研究如同投向深海的探照灯,照亮了海洋微生物生态学研究中最被忽视的暗角。

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