室内尘埃微生物组:受人为化学物质影响及噬菌体介导的抗性与毒力传播

【字体: 时间:2025年04月10日 来源:Microbiome 13.8

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  为探究人为化学物质对室内尘埃微生物组的影响,研究人员对 32 户老年居民家中尘埃进行研究,检测其中 76 种人为化学物质,并分析尘埃微生物组。结果发现这些化学物质影响微生物组分化,且噬菌体促进抗生素抗性基因(ARGs)和毒力基因(VGs)传播,该研究对家居化学管理意义重大。

  在我们的日常生活中,室内环境与健康息息相关,而其中的尘埃常常被忽视。实际上,室内尘埃犹如一个 “小世界”,里面不仅有各种各样的微生物,还存在许多人为产生的化学物质。以往的研究虽然对尘埃中的微生物和化学物质分别进行了一些探索,但对于人为化学物质究竟如何影响尘埃微生物组,我们知之甚少。比如说,这些化学物质是否会改变微生物的种类和数量?是否会影响微生物的功能?这些问题都亟待解决。为了深入了解这些现象背后的机制,香港城市大学等机构的研究人员开展了一项研究,相关成果发表在《Microbiome》杂志上。
研究人员为了开展这项研究,采用了多种关键技术方法。首先,对 32 户位于香港市区的住宅进行采样,收集尘埃样本(样本来自居住着≥72 岁老人的家庭,老人平均在该住宅居住 23 年,每天在家时间≥20 小时) 。然后,通过化学提取和分析程序检测其中 76 种人为化学物质的含量;利用宏基因组测序技术对尘埃中的微生物进行基因测序,并结合多种生物信息学分析方法,研究微生物的多样性、群落组成以及功能等。

研究结果主要如下:

  • 尘埃中多样的人为化学物质:在分析的 76 种人为化学物质中,有 69 种在至少一个尘埃样本中被检测到。内分泌干扰化学物质(EDCs)含量最为丰富,其中双酚 A(BPA)检测频率达 100%,浓度最高。非抗生素药物中,非甾体抗炎药(NSAIDs)占比最多,如对乙酰氨基酚等。抗生素方面,磺胺嘧啶和甲硝唑浓度较高,部分大环内酯类抗生素虽浓度低但检测频率高。
  • 人为化学物质与尘埃微生物组聚类的相关性:尘埃微生物组可分为两个不同的簇。簇 2 与多种人为化学物质相关,尤其是 EDCs 和抗生素,且该簇中化学物质浓度更高。两个簇的微生物群落组成有显著差异,如棒状杆菌在簇 1 中相对丰度更高,而副球菌在簇 2 中更丰富。
  • 人为化学物质水平升高对尘埃微生物组潜在功能的影响:两个簇的微生物代谢功能存在差异。簇 2 中与核苷酸、氨基酸生物合成以及芳香化合物降解相关的代谢途径更丰富,同时该簇中抗生素抗性基因(ARGs)显著富集,尤其是对氨基糖苷类、四环素类和 β - 内酰胺类抗生素的抗性基因。
  • 人为化学物质水平升高与尘埃微生物组中 ARGs、VGs 和 MGEs 共发生的关系:簇 2 中 ARGs、毒力基因(VGs)和移动遗传元件(MGEs)的数量和相对丰度均高于簇 1。网络分析显示,这些基因和元件之间存在显著相关性,且簇 2 的网络更稳定,表明化学物质浓度升高可能增强它们的共选择作用。
  • 人为化学物质水平升高与 ARGs、VGs 和 MGEs 在基因组中共定位的关系:研究人员对代表性宏基因组组装基因组(rMAGs)进行分析,发现 ARGs、VGs 和 MGEs 在簇 2 的 rMAGs 中共定位现象更普遍,且它们之间的距离更短,这意味着在高化学物质浓度环境下,这些基因元件更易发生转移。
  • 人为化学物质水平升高与携带 ARGs 和 / 或 VGs 的噬菌体流行及插入宿主的关系:研究鉴定出多种噬菌体,包括前噬菌体和噬菌体 - 质粒(P - Ps)。簇 2 中富集的噬菌体更多,且这些噬菌体携带更多的 ARGs 和 VGs。部分噬菌体,如 P - Ps,在簇 2 中与宿主的联系更紧密,甚至有将 ARGs 插入宿主基因组的现象。

在研究结论和讨论部分,研究表明室内尘埃是多种 EDCs、非抗生素药物和抗生素的储存库。这些人为化学物质与微生物组的多样性和组成密切相关,还会促进细菌群体中抗生素抗性和毒力的传播。噬菌体,尤其是 P - Ps,在这一过程中发挥了重要作用,可能会增加对儿童和老人等易感人群的健康风险。由于人们大部分时间都在室内,长期接触尘埃中的 ARGs 和 VGs 可能会影响人体微生物组,因此,提高对室内化学物质的管理意识至关重要。不过,该研究也存在一定的局限性,如未涵盖某些常见化学物质和尘埃相关成分,对真菌作用的研究不足,测序技术无法完全明确细菌活力及基因功能等。未来研究可针对这些不足展开,进一步深入探究室内尘埃微生物组与健康之间的关系。
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