基于精简氨基酸字母表(RAAs)预测直系同源蛋白热稳定性的研究及意义
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时间:2025年04月10日
来源:Biologia 1.4
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为探究序列特征对蛋白质热稳定性的影响,研究人员评估 672 种 RAAs 在预测直系同源蛋白热稳定性方面的表现。结果显示,模糊聚类筛选出的 10 种 RAAs 能有效预测,其中 EQ-H–K-DN-IL-P–T-FY-M-R-S-W-A-C-G-V 的 RAA 可拟合点突变引起的热稳定性变化,有助于降低计算复杂度、提高预测精度。
序列特征在决定蛋白质热稳定性方面起着至关重要的作用。鉴于精简氨基酸字母表(RAAs)在降低数据复杂性和保留关键序列信息方面的优势,研究人员评估了 672 种 RAAs 在预测直系同源蛋白热稳定性方面的性能。研究人员计算了精简序列特征的氨基酸组成、二肽组成和三肽组成,并使用随机森林模型进行预测。结果表明,通过模糊聚类选择的 10 种 RAAs 能有效地预测直系同源蛋白对之间的热稳定性差异,显著提高了预测效率。此外,研究人员还预测了点突变引起的熔解温度差 ΔTm,发现 EQ-H–K-DN-IL-P–T-FY-M-R-S-W-A-C-G-V 的 RAA 能够拟合点突变引起的微小热稳定性变化。该研究表明,基于模糊聚类的精简方法可以有效地保留影响蛋白质热稳定性的关键序列特征,从而降低计算复杂性并提高预测准确性。
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