全球古典猪瘟病毒基因组动态与进化选择：基于贝叶斯聚结分析的启示

编辑推荐：针对古典猪瘟病毒(CSFV)全球流行株基因组多样性不足的问题，研究人员通过整合220条全基因组数据（含实验室2条中国源序列MH734359.1/OR428229.1），运用贝叶斯聚结分析揭示其平均进化速率为2.06×10–3替换/位点/年，追溯共同祖先至1877年，并发现持续正向选择压力可能驱动新谱系产生，为高致死率毒株防控策略提供理论依据。

　　古典猪瘟病毒(Classical swine fever virus, CSFV)作为感染家猪和野猪的高致病性RNA病毒，因其高死亡率与发病率对全球养猪业构成严重威胁。尽管已有全基因组研究，但多数局限于少数国家或特定基因区域（如E2）。本研究突破地理限制，从NCBI数据库获取220条CSFV全基因组序列，结合实验室自主测定的2条中国源基因组（登录号MH734359.1与OR428229.1），经严格质控筛选出66条代表性序列进行深度分析。通过贝叶斯聚结模型推算，该病毒平均核苷酸替换速率达2.06×10^–3 substitutions/site/year（95% HPD 6.8012×10^–4–3.3044×10^–3），其最近共同祖先可追溯至1877年（95% HPD 1833.8–1932.3）。选择压力分析显示，CSFV基因组存在持续性的多样化正向选择（pervasive and episodic selection pressure），这种进化驱动力可能加速遗传多样性积累，甚至诱发新致病谱系的诞生。研究成果为预判高毒力基因型的出现及制定精准防控策略提供了关键分子进化依据。