人类活动影响下黄矮稻鼠（Oligoryzomys flavescens）在不同环境中的种群遗传结构研究及其对汉坦病毒防控的意义

《Oecologia》：Population genetic structure in two contrasting human-altered environments of yellow pygmy rice rat Oligoryzomys flavescens

为探究人类活动改变的环境对动物种群的影响，研究人员对汉坦病毒宿主黄矮稻鼠（Oligoryzomys flavescens）开展研究。通过分析布宜诺斯艾利斯不同城市化程度区域及乡村的样本，发现城市环境限制基因流。该研究有助于理解汉坦病毒传播，为防控提供依据。

　　人类活动在全球范围内对景观造成了重大改变。因此，众多动物物种被迫在改变后的自然栖息地残余中适应并生存，这使它们更容易受到遗传漂变的影响。本研究旨在利用全基因组标记评估黄矮稻鼠（Oligoryzomys flavescens，一种汉坦病毒储存宿主物种）在两种截然不同的人类改变环境中的连通程度。研究在阿根廷布宜诺斯艾利斯市及其周边大都市区的 16 个不同城市化程度的地点，以及布宜诺斯艾利斯省的乡村地区展开。从 2017 年至 2019 年收集的 93 个样本中提取基因组 DNA，并分析了通过 ddRADseq 获得的 2456 个单核苷酸多态性（SNPs）。城市地点比乡村地点表现出更多的遗传分化、聚类结构、更多的私有等位基因以及更高数量的亲属关系。在乡村地区，遗传距离和空间距离呈正相关，而在城市地区未检测到相关性。此外，研究分析发现，栖息在两个不同流域河岸环境的个体与远离这两个流域的典型乡村环境个体之间存在一定程度的分化。研究结果表明，与乡村地区相比，城市环境对基因流的限制更大，这可能是由于更高程度的隔离导致扩散受限。这些信息有助于理解汉坦病毒在啮齿动物中的潜在传播，并为设计预防措施以降低其向人类传播的风险提供参考。