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人类肠道古菌组年龄动态:甲烷菌与长寿的隐秘关联
《BMC Microbiology》:Age-related dynamics of predominant methanogenic archaea in the human gut microbiome
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年04月05日 来源:BMC Microbiology 4
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编辑推荐:本研究针对肠道古菌组在衰老过程中的演变规律,通过分析19-109岁人群的宏基因组数据,首次揭示Methanobrevibacter smithii(M. smithii)与Ca. M. intestini的年龄特异性分布特征,发现高甲烷表型在百岁老人中占比达58.82%,其与Oscillospiraceae的协同作用可能补偿衰老相关的丁酸盐代谢缺陷,为理解健康衰老的微生物机制提供新视角。
研究团队采用多队列设计,整合127名19-59岁年轻人、86名60-99岁老年人和34名100-109岁百岁老人的粪便宏基因组数据。通过Kraken2结合UHGG数据库进行物种注释,采用ConQuR算法消除批次效应,运用SparCC构建微生物共现网络,并利用DESeq2分析丁酸盐代谢通路基因差异。关键技术创新在于将新鉴定的Ca. M. intestini纳入分析框架,并首次在百岁老人群体中解析甲烷菌-细菌互作网络。
研究结果揭示三大关键发现:1)年龄分层分析显示,甲烷菌多样性随年龄递减,但百岁老人的古菌组成意外"返老还童",其M. smithii占比回升而Ca. M. intestini下降,与年轻人相似;2)网络分析发现Ca. M. intestini在成年人中维持网络稳定,而百岁老人体内M. smithii与Oscillospiraceae形成高度复杂的互作网络;3)高甲烷表型(定义为Methanobrevibacter相对丰度≥0.1%)在百岁老人中占比达58.82%,显著高于年轻人的25.2%,这些个体表现出丁酸激酶通路基因上调,提示甲烷菌可能通过代谢补偿机制缓解衰老相关的丁酸盐减少。
在讨论部分,作者提出"代谢代偿"假说:衰老过程中Lachnospiraceae等丁酸盐生产菌的减少,可能被甲烷菌-Oscillospiraceae联盟所弥补。特别值得注意的是,新鉴定的Ca. M. intestini在老年群体中占比突出,暗示其在衰老过程中可能扮演过渡角色。研究还发现Thermoplasmata类古菌在老年人中异常增殖,而在百岁老人中回落,这类可能产生有害代谢物的古菌或成为健康衰老的"绊脚石"。
这项研究的意义在于:首次揭示肠道古菌组的U型年龄分布规律,为"健康衰老的微生物标志物"提供新候选;阐明甲烷菌通过种间氢转移重塑肠道代谢网络的机制;提出的"代谢代偿"模型为开发针对衰老相关代谢紊乱的微生物干预策略指明方向。正如研究者Christine Moissl-Eichinger强调的:"这些产甲烷的古菌不是简单的旁观者,它们可能是维系宿主代谢健康的关键共生体。"
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