全基因组解析鸡爪槭 NAC 转录因子及其在叶片衰老中的表达调控机制:开启植物衰老研究新视野

《Genes & Genomics》:Genome-wide identification of NAC transcription factors in Acer paxii, and their expression dynamics during leaf aging

【字体: 时间:2025年04月02日 来源:Genes & Genomics 1.6

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  为探究鸡爪槭(Acer paxii)中 NAC 转录因子的调控机制,研究人员开展了对 A. paxii 基因组中 NAC 基因(ApNACs)的全基因组分析。结果鉴定出 117 个 ApNACs,明确其分布、分类等,还发现相关调控元件及关联 TF 家族,有助于理解 NAC 介导的调控网络。

  背景:NAC 家族(由 NAM、ATAF1/2 和 CUC2 组成)是植物特有的关键转录因子家族,在植物生长、发育及应对非生物胁迫等方面发挥重要作用。然而,鸡爪槭(Acer paxii)中 NAC 调控的潜在机制尚未被探讨。目标:鉴定鸡爪槭基因组中的 NAC 基因(ApNACs),并探索 NAC 在介导叶片衰老中的调控网络。方法:对鸡爪槭基因组中的 NAC 基因家族进行全面的全基因组分析。结果:从鸡爪槭基因组数据库中鉴定出 117 个 ApNACs,它们不规则地分布在 13 条染色体上。系统发育分析表明,ApNAC 基因可分为 16 个亚组。ApNACs 基因启动子区域存在 4 种顺式调控元件。利用转录组数据比较不同时间 ApNAC 基因的表达水平,并选取 6 个 ApNAC 基因进行 qRT-PCR,结果与转录组结果基本一致。选取 6 个 ApNACs 和 187 个来自不同家族的转录因子(TFs),发现相关性最高的 TF 家族是 WRKY、MYB、bZIP 和 ERF,且这些 TF 家族已被报道参与衰老调控功能。结论:该研究为鉴定鸡爪槭的 NAC 基因家族以及 ApNAC 基因对植物衰老的调控功能提供了重要数据支持,有助于理解鸡爪槭中 NAC 介导的调控网络。

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