预染Marker条带异常?别慌!先来看看你都踩了几个坑

【字体: 时间:2025年03月27日 来源:基因有限公司

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  本文从弥散、缺失、小分子不显、颜色异常、转膜失败五大痛点出发,深度解析预染Marker的隐藏“雷区”,附独家解决方案,实验人速速收藏!

预染Marker能实时追踪电泳进度,堪称Western Blot的“导航仪”,但用不好反而会“迷路”——条带模糊、缺失、上宽下窄/下宽上窄、颜色异常……本文从弥散、缺失、小分子不显、颜色异常、转膜失败五大痛点出发,深度解析预染Marker的隐藏“雷区”,附独家解决方案,实验人速速收藏!

一、条带弥散:预染Marker变“马赛克”?

  • 上样量过多

上样量过多会导致蛋白在凝胶中扩散不均匀,从而出现弥散现象。建议减少上样量,按照说明书来操作。

  • 电泳条件不当

电压过高或电泳时间过长会导致电泳缓冲液温度升高,进而使蛋白条带弥散。建议根据产品说明书调整电泳条件,避免长时间高电压运行。

  • 凝胶浓度问题

凝胶浓度过低可能导致小分子蛋白弥散,而过高则可能影响大分子蛋白的分离。建议根据蛋白Marker的分子量范围选择合适的凝胶浓度。

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自制凝胶浓度推荐(图片源自CST)

  • 缓冲液问题

电泳缓冲液陈旧或pH值不在缓冲范围内,也可能导致条带弥散。建议使用新鲜的电泳缓冲液,并在使用前预冷缓冲液。

  • 边缘效应

如果蛋白Marker放置在凝胶的边缘泳道,可能由于边缘效应导致条带变形或弥散。建议条件许可的条件下,尽量避免边缘条带。

二、条带缺失:预染Marker“中途消失”?

转膜前条带缺失

  • 凝胶浓度选择不当

凝胶浓度过低可能导致小分子量条带无法很好地分散,而过高则可能使大分子量条带无法充分展开。建议根据蛋白Marker的分子量范围选择合适的凝胶浓度。

  • 电泳时间不足或过长

电泳时间过短可能导致部分条带未能完全分离,而过长则可能使条带跑出凝胶。建议在溴酚蓝前沿刚跑出胶时停止电泳。

  • 蛋白Marker降解

如果蛋白Marker本身降解或在电泳过程中降解,可能导致条带缺失。建议检查Marker的有效期和保存条件,避免反复冻融。

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电泳及转膜后均无55KDa 条带

  • 样品污染或交叉污染

如果相邻泳道的样品污染了Marker,可能导致条带异常。建议在操作过程中使用干净的试剂和耗材。

转膜后条带消失

  • 转印方式选择不合适

预染Marker的>100 kDa蛋白需湿转(250 mA, 2小时)或半干转(25 V, 30分钟),半干转易遗漏大分子。

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湿转转膜时间推荐(图片源自CST)

  • 转印膜选择不当

0.45 μm PVDF膜孔径大,小分子预染蛋白(如10 kDa)易穿透,建议更换0.2 μm膜或硝酸纤维素膜。

三、小分子量蛋白“隐身”:预染也救不了?

  • 凝胶浓度问题

小分子蛋白需要较低浓度的凝胶才能有效分离。如果凝胶浓度过高,小分子蛋白条带可能无法清晰显示。

  • 电泳条件不当

电泳时间过长可能导致小分子蛋白条带跑出凝胶。建议适当缩短电泳时间。

  • SDS结合不充分

小分子蛋白与SDS结合较少,在电场中迁移时容易弥散。建议优化电泳条件,如使用高浓度凝胶分离,增加浓缩胶比例以及控制电泳温度以免过度加热,增加样品上样量等。

四、颜色异常:预染Marker“褪色”或“变色”?

  • 保存和使用问题

预染蛋白Marker保存不当(如反复冻融、暴露在高温或强光下)可能导致部分条带降解或颜色褪去。建议妥善保存Marker,并避免加热。

  • 设备问题

电泳槽内存在气泡、电极连接不正确或电泳槽温度不均匀,可能导致条带显示异常。建议检查电泳设备,确保其正常运行。

  • 缓冲液问题

转膜缓冲液中甲醇浓度过高(>20%)可能剥离预染蛋白的染料,使条带变淡或丢失。建议根据实验需求调整甲醇浓度至10%-15%,以确保转膜效果和条带清晰度。

相信大多数同学,尤其是新手师弟师妹都踩过绝大多数“坑”,预染Marker虽“聪明”,但也需小心伺候!从低温保存到转膜优化,每个细节都可能是成败关键。下次遇到条带异常时,对照这份攻略逐一排查,轻松搞定“消失的条带”!转发给战友,实验路上少走弯路!

下期揭秘以下问题,敬请关注

1、为什么Marker条带上宽下窄或者上窄下宽

2、标签抗体检测的Marker条带

3、Marker指示的蛋白大小和理论值有差异

4、还有能不能用于非变性胶

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