综述：新生儿胃肠道感染相关病原体的流行情况：一项系统综述和荟萃分析

《Gut Pathogens》：Prevalence of pathogens associated with neonatal gastrointestinal infections: a systematic review and meta-analysis

这篇综述通过系统综述和荟萃分析，总结了新生儿胃肠道感染常见病原体的流行率，发现不同检测方法和症状下病原体检测存在差异，且肠道病原体感染与新生儿坏死性小肠结肠炎（NEC）风险增加有关，为临床诊疗提供了重要依据。

　　

一、研究背景

胃肠道感染是全球重要的健康负担，在婴幼儿死亡原因中位居第二。新生儿由于肠道免疫反应不成熟、肠道菌群失调、生理脆弱且接触病原体机会多，尤其容易感染胃肠道疾病 。传统检测肠道病原体的方法，像血培养和粪便培养等，虽可靠但耗时耗力，还可能漏检某些病原体，影响治疗 。分子生物学方法如聚合酶链反应（PCR）和宏基因组下一代测序（mNGS）虽能提高检测能力，但 PCR 诊断范围有限，mNGS 成本高昂。明确新生儿胃肠道感染的病原体谱，对优化分子诊断方法和指导经验性抗生素使用意义重大，因此本研究开展了荟萃分析。

二、研究方法

1. 文献检索策略：在 PubMed、Web of Science、Cochrane Library 和 EMBASE 数据库中检索相关文献，检索词包括（Infant OR Newborn OR Neonate）AND (Intestinal Disease) AND (Culture OR Multiplex PCR OR 16S rRNA OR mNGS) ，不限日期和语言，检索截止日期为 2025 年 1 月 8 日，且研究已在 PROSPERO 注册（标识符 CRD42023478114）。
2. 纳入与排除标准：纳入临床研究、涉及新生儿胃肠道疾病、包含不同性别和胎龄新生儿、采用病原体检测方法且成功鉴定病原体的研究；排除非新生儿研究、与胃肠道感染无关的研究、病例数少于 5 人的病例报告、仅检测特定病原体的研究、以摘要或综述形式发表的研究等 。
3. 数据提取与质量评估：用自定义的 Excel 表格提取数据，包括作者、研究地点、研究类型等。使用 Joanna Briggs Institute（JBI）批判性评价工具评估纳入研究的质量，从样本收集、招募方法等 9 个方面进行评价，根据 “yes” 回答的比例判断研究偏倚风险。
4. 统计分析：进行荟萃分析评估新生儿胃肠道感染检测阳性率和病原体阳性率。通过 Cochrane Q 检验和I2统计量评估研究间的异质性，根据异质性结果选择固定效应模型或随机效应模型。进行亚组分析、Meta 回归和敏感性分析，用漏斗图和 Egger’s 检验评估发表偏倚，所有分析均使用 R 软件（版本 4.2.3）的 “meta” 包完成。

三、研究结果

1. 文献筛选结果：最初检索到 7094 篇文章，去除重复后剩余 5819 篇，经标题和摘要筛选排除 5132 篇，全文筛选排除 147 篇，最终纳入 23 篇文章，涵盖 1975 年至 2022 年的研究，包括 4 个病例对照研究和 19 个病例系列研究。
2. 研究对象特征：23 项研究共纳入 5475 例新生儿胃肠道感染患者，主要症状包括腹泻（3140 例）、坏死性小肠结肠炎（NEC，1127 例）、胃肠道穿孔（791 例）等。
3. 诊断方法分析：排除 1 例特殊研究后，对 22 项研究分析发现，血液培养是最常用的诊断方法，在 9 项研究中的综合阳性率为 34.7%（95% CI 24.3 - 46.0%，I2=87%）；腹膜培养在 10 项研究中的综合阳性率为 55.8%（95% CI 33.5 - 77.0%，I2=96%）；粪便培养在 8 项研究中的综合阳性率为 21.3%（95% CI 10.7 - 34.2%，I2=92%）。亚组分析显示，腹膜培养阳性率显著高于其他检测方法，高收入国家、美洲地区以及小样本研究的阳性率更高。
4. 病原体检测率：总体上，大肠杆菌（Escherichia）的合并阳性率最高（22.2%；95% CI 8.3 - 40.4%，I2=98%） ，其次是梭菌属（Clostridium ，21.8%；95% CI 2.2 - 53.8%，I2=96% ）、克雷伯菌属（Klebsiella ，19.2%；95% CI 8.3 - 33.4%，I2=97% ）等。在不同检测方法中，血液培养里大肠杆菌阳性率最高（10.0%；95% CI 3.1 - 20.4%，I2=92%），腹膜液培养中克雷伯菌阳性率最高（24.7%；95% CI 6.6 - 49.5%，I2=95%），粪便培养中大肠杆菌阳性率最高（11.0%；95% CI 3.8 - 21.3%，I2=75%） 。不同症状患者的病原体检测存在差异，NEC 患者中大肠杆菌和克雷伯菌最常被检测到，腹泻患者中弧菌属（Vibrio）和气单胞菌属（Aeromonas）是主要病原体，胃肠炎患者中轮状病毒（Rotavirus）和弯曲菌属（Campylobacter）最常见。
5. 敏感性分析与发表偏倚：敏感性分析表明研究结果稳健，新生儿胃肠道感染阳性率在 46.9% - 51.9% 之间 。漏斗图和 Egger’s 检验显示存在发表偏倚的可能性。

四、讨论

1. 感染谱与诊断方法：本研究首次全面总结了新生儿胃肠道感染的病原体谱，发现肺炎克雷伯菌（Klebsiella pneumoniae）、大肠杆菌（Escherichia coli）等是关键病原体。腹膜培养阳性率显著高于其他诊断方法，但因其操作具有侵入性，不能常规用于非手术患者。粪便培养因受肠道定植影响，且在指导初始治疗决策方面存在挑战，较少单独使用。分子检测方法虽有优势，但复杂且昂贵，不适合常规临床应用。建议低收入地区采用成本效益高的传统诊断方法，中高收入地区在传统检测基础上增加分子诊断方法。
2. 病原体与疾病关系：临床医生在微生物学诊断确认前，需进行有效的经验性治疗。研究发现的常见病原体对指导抗生素选择意义重大，如大肠杆菌是全球婴儿腹泻的主要病原体之一 。同时，肠道病原体感染与新生儿 NEC 关系密切，NEC 患者病原体检测率显著高于其他疾病患者，提示肠道感染可能引发 NEC 。在 NEC 发病前，肠道菌群会发生变化，优势菌如肺炎克雷伯菌、大肠杆菌等可能通过损伤肠道上皮细胞，导致 NEC 并引发全身炎症反应。
3. 研究局限性：本研究存在一定局限性，多数研究来自发展中国家，可能存在地理偏倚，研究结果的全球适用性受限。研究中病例对照研究较少，多为病例系列研究，难以严格建立因果关系，影响研究结果的普遍性。此外，部分研究聚焦单一病原体，可能忽略共感染情况，虽排除这些研究可避免感染谱偏差，但也限制了研究结果的全面性。

五、结论

本荟萃分析详细描述了新生儿胃肠道感染的病原体谱，确定了肺炎克雷伯菌、大肠杆菌、念珠菌（Candida）、轮状病毒、腺病毒（Adenovirus）等高度疑似病原体，证实肠道病原体感染与新生儿 NEC 风险增加有关，且腹膜培养在检测胃肠道感染方面具有显著优势。未来需要开展前瞻性研究，覆盖更多地区，结合新兴诊断方法，开发更精准的诊断工具，以优化新生儿胃肠道感染的诊疗策略。