解析 DNA 损伤奥秘：单细胞测序揭示损伤与基因调控关联及疾病风险

《Nature Methods》：Single-cell parallel analysis of DNA damage and transcriptome reveals selective genome vulnerability

为解决分析 DNA 损伤受细胞组成和损伤随机性干扰的问题，研究人员开发 Paired-Damage-seq，发现损伤与表观遗传变化有关，可预测疾病风险。

　　

在多细胞生物中，基因组完整性的维持对分子程序至关重要。在整个生命过程中，各种内源性和环境因素持续威胁基因组，可能导致 DNA 损伤。理解 DNA 损伤的功能后果需要研究其在基因组中的偏好分布以及对基因调控程序的影响。

然而，器官内复杂的细胞类型组成和损伤形成的随机性导致的高背景水平阻碍了这类分析。

为应对这些挑战，研究人员开发了配对损伤测序（Paired-Damage-seq）技术，用于在单细胞水平上联合分析氧化和单链 DNA 损伤与基因表达。

研究人员以培养的 HeLa 细胞和小鼠大脑为模型应用该方法。结果表明，损伤形成与表观遗传变化之间存在关联。氧化 DNA 损伤热点的分布呈现细胞类型特异性模式；这种选择性的基因组脆弱性反过来可以预测细胞类型以及导致疾病风险的失调分子程序。