《Cell Death & Differentiation》:NAT10-mediated N4-acetylcytidine modification in KLF9 mRNA promotes adipogenesis
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为探究 NAT10 与脂肪生成及肥胖的关系,研究人员发现 NAT10 促进脂肪生成,或为肥胖防治提供新靶点。
在当今社会,肥胖问题日益严峻,它就像一颗隐藏在健康背后的 “定时炸弹”,常常引发如糖尿病、冠心病和高血压等危及生命的疾病,严重威胁着人类的健康。肥胖的根源在于脂肪生成过程出现异常,这个过程就像是一场失控的 “细胞狂欢”,脂肪细胞疯狂增殖和肥大,导致脂肪堆积越来越多。
在分子生物学的微观世界里,mRNA 的转录后修饰是调控各种生物过程的关键环节,其中 N6- 腺苷甲基化(m6A)、N1- 腺苷甲基化(m1A)和胞嘧啶羟化(m5C)等修饰已被广泛研究。然而,N4- 乙酰胞苷(ac4C)修饰在 mRNA 中的作用却一直是个未解之谜,尤其是它在脂肪生成和肥胖发生过程中的角色,几乎无人涉足。
中南大学湘雅三医院的研究人员为了揭开这层神秘的面纱,开展了一项深入的研究。他们发现,N - 乙酰基转移酶 10(NAT10)在肥胖个体和高脂饮食小鼠的脂肪组织中显著上调,这一发现就像是在黑暗中点亮了一盏明灯,为后续的研究指明了方向。进一步研究表明,NAT10 通过对 Krüppel 样因子 9(KLF9)mRNA 进行 ac4C 修饰,增强了 KLF9 mRNA 的稳定性,进而激活了 CCAAT 增强子结合蛋白 α/β- 过氧化物酶体增殖物激活受体 γ(CEBPA/B-PPARG)通路,促进了脂肪生成。此外,研究还发现,特异性 NAT10 抑制剂 Remodelin 能够通过抑制 KLF9 mRNA 的 ac4C 修饰,显著降低体重、减小脂肪细胞大小和抑制脂肪组织扩张。这一系列的研究成果发表在《Cell Death & Differentiation》杂志上,为肥胖的预防和治疗提供了全新的思路和潜在的治疗靶点。
研究人员在这项研究中运用了多种关键技术方法。他们收集了人类和小鼠的多种组织样本,包括肥胖患者和正常个体的皮下脂肪组织(SATs)、内脏脂肪组织(VATs),以及不同饮食条件下小鼠的腹股沟白色脂肪组织(iWATs)、附睾白色脂肪组织(eWATs)等。同时,采用了 acRIP-seq 和 RNA-seq 技术筛选 NAT10 的靶基因,通过双荧光素酶报告基因实验验证 NAT10 与 KLF9 的结合,还利用 RNA 稳定性实验探究 KLF9 mRNA 的稳定性变化。
在研究结果方面,首先发现 NAT10 在肥胖患者和高脂饮食小鼠的脂肪组织中表达上调。研究人员收集不同组织样本检测发现,hNAT10 和 mNAT10 在人体和小鼠的多种组织中广泛表达,且在肥胖患者的 SATs 和 VATs 中,hNAT10 的 mRNA 和蛋白表达水平均高于正常个体;在高脂饮食小鼠的 eWATs 和 iWATs 中,mNAT10 表达也显著上调,并且随着高脂饮食时间延长,mNAT10 表达逐渐增加。同时,在 hADSCs 和 3T3-L1 细胞脂肪生成过程中,NAT10 以及脂肪生成标记物的表达和细胞内甘油三酯(TG)含量也逐渐增加。
其次,研究证实 mRNA ac4C 修饰在脂肪生成过程中增加。通过免疫印迹和斑点印迹实验发现,肥胖患者 SATs 和 VATs 中的 mRNA ac4C 修饰水平显著高于正常体重患者;高脂饮食小鼠的 eWATs 和 iWATs 中,mRNA ac4C 修饰也明显增加,且在 iWATs 中随着高脂饮食时间延长而增强;在体外培养的 hADSCs 和 3T3-L1 细胞脂肪生成过程中,mRNA ac4C 修饰同样逐渐上升。
然后,研究表明 NAT10 促进脂肪生成。对 hADSCs 和 3T3-L1 细胞进行 NAT10 过表达或沉默处理后发现,过表达 NAT10 可显著加速 hADSCs 脂肪生成,沉默 NAT10 则强烈抑制其脂肪生成。同时,NAT10 过表达或沉默会使细胞培养基中的游离脂肪酸(FFA)浓度、细胞内 FFA 和 TG 含量相应增加或减少,脂肪生成相关蛋白 CEBPA、FABP4 和 PPARG 的表达也会发生改变,但棕色脂肪组织(BATs)的标记物 UCP1、HSL 和 ATGL 的表达不受影响。在 3T3-L1 细胞中也得到了类似的结果,且 mRNA ac4C 修饰水平会随着 NAT10 表达的变化而改变。
接着,研究确定 NAT10 在脂肪生成中介导 mRNA ac4C 修饰。对 3T3-L1 细胞进行 siRNA 干扰后,利用 acRIP-seq 和 RNA-seq 筛选可能的靶基因。结果显示,在 acRIP-seq 中检测到大量差异 ac4C 峰,主要分布在 3’-UTR、编码序列(CDS)和 5’-UTR;RNA-seq 检测到大量差异表达基因(DEGs),这些基因在脂肪细胞分化、脂质代谢调节等过程中显著富集。通过分析,发现有 30 个基因在 acRIP-seq 中呈现低乙酰化,在 RNA-seq 中表达下调,这表明 NAT10 介导的 mRNA ac4C 修饰在脂肪生成中发挥重要作用。
随后,研究揭示 NAT10 介导 KLF9 mRNA ac4C 修饰调节脂肪生成。通过筛选发现 mKLF9 可能是 NAT10 的靶基因,acRIP-PCR 验证了 mNAT10 或 hNAT10 可对 mKLF9 或 hKLF9 mRNA 进行 ac4C 修饰。研究还发现,hKLF9 和 mKLF9 在肥胖个体和高脂饮食小鼠的脂肪组织中表达上调,且在脂肪生成过程中逐渐增加。进一步实验表明,NAT10 通过调节 mKLF9 mRNA 的稳定性,进而调控 CEBPA/B-PPARG 通路,促进脂肪生成。双荧光素酶报告基因实验证实 NAT10 可与 mKLF9 的 3 个基序和 hKLF9 的 1 个基序结合。
最后,研究发现 Remodelin 通过抑制 KLF9 mRNA ac4C 修饰抑制脂肪生成。在 3T3-L1 细胞实验中,Remodelin 以剂量依赖的方式抑制脂肪生成,降低细胞内 FFA 和 TG 含量,且不影响细胞活力。在体内实验中,给小鼠灌胃 Remodelin 后,其体重、iWATs 和 eWATs 的大小和重量均显著降低,脂肪细胞变小,同时 mKLF9 mRNA ac4C 修饰水平下降,相关蛋白表达受到抑制。
在研究结论和讨论部分,研究人员指出,NAT10 通过促进 KLF9 mRNA 的 ac4C 修饰,增强其稳定性,激活 CEBPA/B-PPARG 通路,从而促进脂肪生成。这一发现揭示了 mRNA ac4C 修饰在脂肪生成中的重要作用,为深入理解肥胖的发生机制提供了新的视角。此外,Remodelin 作为一种潜在的治疗肥胖的小分子抑制剂,展现出了良好的应用前景。然而,目前对于 mRNA ac4C 修饰的研究还处于起步阶段,其在 5’-UTR 的修饰机制以及对 mRNA 和蛋白表达的影响仍有待进一步探索。未来,有望通过深入研究,为肥胖的防治提供更有效的策略和方法。
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