New Crops | 钱前/商连光团队综述野生稻基因组和优异基因挖掘利...

　　

　　

近日，中国农业科学院深圳农业基因组研究所（岭南现代农业科学与技术广东省实验室深圳分中心）联合崖州湾国家实验室等国内多家单位在《新作物（New Crops）》上在线发表了题为“Genetic resource utilization in wild rice species: Genomes and gene bank”的研究综述。论文系统综述了野生稻遗传资源的发展与前景，全面汇总了野生稻物种中积累的基因组和基因资源等重要成果，强调了其中与生物和非生物胁迫抗性、产量性状和其他性状等关键农艺性状相关的重要功能变异，并对野生稻挖掘和利用进行了展望。

长期的人工驯化和定向选择使得现代水稻品种的遗传基础日趋狭窄，给水稻的遗传改良带来了重大挑战，而探索和利用近缘野生种质资源是克服这一瓶颈的主要途径。稻属包含超过二十个不同基因组类型的野生稻物种，具有远超栽培稻的丰富遗传多样性，是现代水稻育种不可或缺的重要遗传资源。近年来，随着测序技术的进步，野生稻基因组学和遗传学获得了快速发展，积累了大量高质量的野生稻基因组数据和与重要农艺性状相关的优异基因资源，已成为当前水稻种质资源利用的研究焦点，也是水稻进一步遗传改良的重要基础。

本文系统归纳了稻属现存的6个二倍体和4个多倍体类型，包括23个野生物种在支架、染色体和端粒到端粒等不同组装水平的基因组组装成果及其基因注释信息，全面总结了野生稻种质资源利用的重要成果，包括与水稻生物和非生物胁迫抗性、产量性状及其他关键性状相关的优异功能基因以及能够调控这些基因表达或功能的关键因果变异信息。同时，该论文探讨了野生稻种质资源利用所面临的遗传差异大和杂交困难等一系列问题及其潜在的应对策略，展望了野生稻种质资源利用的前景和发展方向。

图1 已积累的野生稻基因组数据和重要功能基因

图2 野生稻遗传资源的发掘与利用

基因组所（大鹏湾实验室）才晓溪博士后和贺文闯副研究员为论文的共同第一作者，基因组所（大鹏湾实验室）商连光研究员和崖州湾国家实验室钱前院士为论文的共同通讯作者。研究得到国家自然科学基金基础研究中心项目和中国农科院青年创新专项资金资助。

原文链接：https://doi.org/10.1016/j.ncrops.2025.100065