Nature子刊：新冠病毒检测灵敏度提高100倍！

新型冠状质量检测比快速抗原检测灵敏度高100倍

　　

 

   

新型检测蓝染拭子材料在实验室机器人的帮助下在测序装置中的样品。

资料来源:Felix Heyder /波恩大学医院

波恩大学开发了一种新的新冠病毒检测方法可以使用测序技术同时分析大量拭子，并且具有高灵敏度，能检测出低剂量的病毒，这种创新的方法提供了巨大的潜力。

这一研究结果发表在Nature Biotechnology杂志上。

除接种疫苗外，为了有效监测和控制冠状病毒大流行期间的感染传播，对人群进行系统检测仍然具有关键重要性。只有这样，才能通过有针对性的措施有效监测和遏制病毒的传播。

波恩大学医院(UKB)开发的创新检测方法：LAMP-Seq为许多人定期检测SARS-CoV-2病毒提供了可能性。通过这种方法，可以在早期发现感染，相应的感染链可以迅速中断。

“LAMP-Seq比当前快速抗原检测检测低数量病毒灵敏度提高了100倍，是常见qPCR测试中灵敏度最高的检测方法，”Jonathan Schmid-Burgk教授说。

除此之外，LAMP-Seq还具有高可扩展性。Schmid-Burgk说，LAMP-Seq方法不仅能检测原始SARS-CoV-2病毒的感染，还能检测与α到δ相关的新变体。

对于“LAMP- seq”测试方法，波恩科学家采用了已经确立的LAMP方法(“环介导等温扩增”——在恒温下传播病毒基因组)，并使其与用于生物医学研究的测序机器兼容。因此，许多样品可以在高通量过程中同时进行分析。在对数千个样本进行测序分析之前，每个样本都与分子条形码相连。这个条形码确保即使是数以千计的样本汇集在一起，都可以准确的被检测分析。

人类遗传学研究所的Kerstin Ludwig博士说:“因此，如果检测结果呈阳性，就不再需要对全部样本进行重新检测了。”与qPCR测试相比，该技术显著降低了每次测试的成本，并使“LAMP-Seq”程序成为可扩展的冠状病毒质量测试。

由于其高通量和敏感性，“LAMP-Seq”检测可以为筛查未被发现的感染作出重要贡献。特别是在学校或公司，很多人经常见面，这种检测是系统和预防性监测感染发生的理想方法。

UKB医疗主任兼首席执行官Wolfgang Holzgreve教授解释了新的冠状病毒监测检测方法的好处：“为了有效控制大流行，必须在感染者传染他人之前发现感染者。为了实现这一目标，我们需要具有最高敏感性的大规模筛查，以便为我们提供现有感染链的详细情况。这正是UKB开发的LAMP-Seq所适用的地方。“

即使是更小型号的测序机也能够在一次运行中分析大约10,000个样本(持续时间:大约10到12小时)。这实际上消除了实验室检测的限制因素。

在几项总共约2万个检测的大型研究(包括学校和员工检测)中，波恩的科学家完成了广泛检测、优化并成功验证了整个上下游，从通过咽拭子收集样本到测试结果的全数字反馈。

虽然波恩的科学家目前将他们的创新方法完全集中在SARS-CoV-2检测上，但LAMP-Seq将来也可用于其他病毒(如甲型流感病毒)检测的鉴别诊断，也可快速适应其他病毒。

科学家们目前正致力于CE认证，以便在不久的将来使“LAMP-Seq”检测在国际上使用。

（生物通）

原文检索：

Publication: Kerstin U. Ludwig, Ricarda M. Schmithausen, David Li, Max L. Jacobs, Ronja Hollstein, Katja Blumenstock, Jana Liebing, Miko?aj S?abicki, Amir Ben-Shmuel, Ofir Israeli, Shay Weiss, Thomas S. Ebert, Nir Paran, Wibke Rüdiger, Gero Wilbring, David Feldman, Bärbel Lippke, Nina Ishorst, Lara M. Hochfeld, Eva C. Beins, Ines H. Kaltheuner, Maximilian Schmitz, Aliona Wöhler, Manuel Döhla, Esther Sib, Marius Jentzsch, Jacob D. Borrajo, Jonathan Strecker, Julia Reinhardt, Brian Cleary, Matthias Geyer, Michael Hölzel, Rhiannon Macrae, Markus M. Nöthen, Per Hoffmann, Martin Exner, Aviv Regev, Feng Zhang, Jonathan L. Schmid-Burgk: "LAMP-Seq enables sensitive, multiplexed COVID-19 diagnostics using molecular barcoding", Nature Biotechnology 2021, Internet: https://www.nature.com/articles/s41587-021-00966-9