哈工大蒋庆华：人工智能加单细胞测序筛选出高效的新冠病毒中和抗体

哈尔滨工业大学蒋庆华教授团队通过单细胞免疫组库测序与人工智能算法，筛选到一个新的高效的新冠病毒中和抗体，是潜在的靶向治疗药物，有助于新冠肺炎精准医疗，具有重要意义。

　　

生物通报道：抗体是机体对抗病毒感染重要的武器，机体感染新冠病毒后免疫系统产生的中和抗体与新冠病毒结合，进而阻断其感染人体细胞，是理想的新冠肺炎特效治疗药物。

国内外在新冠病毒中和抗体研发方面取得了积极进展，然而新冠病毒持续变异，筛选新的高效的新冠病毒中和抗体对于新冠肺炎治疗具有重要意义。

哈尔滨工业大学蒋庆华教授在国家自然科学基金委新冠疫情应急攻关项目、哈工大新冠疫情应急攻关项目的支持下，联合哈尔滨兽医研究所所长步志高和哈尔滨市传染病医院院长王静伟团队，在新冠病毒中和抗体筛选研究方面取得重要进展，研究成果以“Single cell RNA and immune repertoire profiling of COVID-19 patients reveal novel neutralizing antibody“为题于近期在Protein & Cell期刊发表，哈尔滨工业大学蒋庆华教授和王平平博士、哈尔滨兽医研究所所长步志高为该研究论文的通讯作者。

图. 基于单细胞转录组及免疫组库测序的新冠病毒特异性中和抗体筛选

蒋庆华团队在哈尔滨市传染病医院采集了16名新冠肺炎痊愈者出院当天的血样，在哈尔滨兽医研究所完成单细胞提取与建库，通过混合细胞免疫组库深度测序以及单细胞转录组、TCR和BCR测序，获得了670万条BCR抗体序列，并通过人工智能算法，筛选出347条候选的中和抗体序列，对其中100条序列进行抗体生产以及ELISA实验，最终发现15个跟新冠病毒S蛋白结合的抗体。

研究人员进一步通过假病毒和真病毒实验，发现69号抗体具有理想的中和活性，可高效阻断新冠病毒感染宿主细胞，是治疗新冠肺炎潜在的靶向药物。

作者简介：

蒋庆华，博士，教授，博士生导师，国家优秀青年科学基金获得者，国家科技创新2030“新一代人工智能”重大项目评审专家、国家重点研发计划重大项目会议评审专家、教育部长江学者奖励计划评审专家，主要从事复杂疾病的信息获取与处理研究，包括基于单细胞测序技术的肿瘤免疫与神经免疫数据分析理论与方法、肿瘤新生抗原预测模型与算法、基于云的高通量基因组数据分析流程研发，迄今共发表第一或通讯作者SCI论文60余篇，包括6篇《PNAS》（IF: 9.66）、3篇《Nucleic Acids Research》（IF：11.56）、2篇《Bioinformatics》（IF：5.61）、2篇《Annals of Neurology》（IF: 9.89），单篇SCI最高他引超1200次（google scholar统计）。

主持国家自然科学基金重点项目、优秀青年项目、面上、新冠肺炎应急攻关等项目5项、国家重点研发计划课题1项，作为技术骨干参与国家863计划重大项目2项，2010年获“中国百篇最具影响国际学术论文”、2011年获“第十二届黑龙江省自然科学技术学术成果一等奖”（排名第1）、2012年入选“哈尔滨工业大学基础研究杰出人才培育计划III类”、 2015年入选“哈尔滨工业大学青年拔尖人才选聘计划（破格教授）”、2016年获“国家开发银行科技创新奖”、2017年担任国际著名SCI期刊《Journal of Alzheimer's disease》副主编（Associate Editor, IF: 3.7），2018年入选哈工大基础研究杰出人才“跃升”培育计划，2019年获黑龙江省自然科学一等奖。

原文标题：

Single cell RNA and immune repertoire profiling of COVID-19 patients reveal novel neutralizing antibody

https://link.springer.com/article/10.1007/s13238-020-00807-6