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致癌新机制:“选择性剪接”
【字体: 大 中 小 】 时间:2017年09月26日 来源:生物通
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一些癌症受基因突变驱动,但是另一些癌症的致病机制仍然不明。通过分析4000例病患的肿瘤样本,科学家们发现了几种与癌症有关的细胞进程变化,其中选择性剪接变化更是与多种疾病生物过程有关的重要机制。
由于正常细胞周期基本机制(如复制、DNA修复和细胞死亡)遭到破坏,在世界范围内,癌症已成为死亡的主要原因之一。
在基因组测序技术的帮助下,如今的生物医学研究人员已经可以鉴定不同肿瘤患者体内的常见遗传突变。
通常情况,人们认为只有DNA突变会导致癌症。9月21日《Cell Reports》杂志报道,选择性剪切(alternative splicing,也叫可变剪接)也能引发癌症。
本文总结的癌症相关突变(图A)、肿瘤样本中不同蛋白质特征的功能性得与失(图B)、前20个癌症驱动者的功能性转变(图C)、与蛋白质结构域家族功能的同工型转换明显丧失有关的细胞组分和分子功能本体映射(图B)
虽然DNA是细胞生长、成熟、分裂和死亡的指导手册,但是实际的执行者是蛋白质。蛋白质生产是一个高度自治的复杂机制:组成基因的DNA片段被转录成RNA,再通过RNA翻译成蛋白质。每一种基因都可以通过选择性剪接产生几种RNA,
通过分析“癌症基因组图谱(TCGA项目)”的基因组数据,庞培法布拉大学的Eduardo Eyras课题组将重点放在了肿瘤的可变剪接,并测试了这些变化影响基因功能的具体模式。研究结果表明,选择性剪接方式变化导致了蛋白质功能结构域的全面丧失,尤其是功能被癌症基因突变牵连的那些结构域。
“我们之前的研究表明,选择性剪接可以预测肿瘤类型和肿瘤阶段,”Eyras说。“在这项新研究中,我们发现选择性剪接变异影响蛋白质功能的机理与遗传突变影响蛋白质功能的机理是类似的。”
所有直接导致蛋白质功能变化的细胞过程都会引起细胞形态和功能的改变,使细胞染上肿瘤细胞特性。
根据这项新研究,选择性剪接变化亦可使健康细胞癌变,这是一项与癌基因突变频率高低无关的新机制,它能作用于任何基因。
“选择性剪接变化为癌症提供了逃避细胞精准调节的新途径,因此,该隐藏途径的揭示将为医学界开辟癌症治疗新道路,”Eyras说。如欲了解新一代测序技术在癌症研究中的最新应用,请点击此处索取更多资料。
原文标题:The Functional Impact of Alternative Splicing in Cancer
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