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最新《Nature Methods》报道“显微镜成像技术”重要技术成就
【字体: 大 中 小 】 时间:2017年09月04日 来源:生物通
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冷冻电子断层扫描术(Cryo-electron tomography)让科研人员有能力详细了解细胞内部微观结构。过去,剖析单个细胞的三维结构通常需花费一周时间,如今,仅需用时1小时!
生物通报道:这项自动化新技术的开发团队来自贝勒医学院和新加坡国立大学,未来科学家们将能在短时间内处理海量的多品种细胞,从而全局地详细了解整个细胞和疾病进程。这项重大技术性突破发表在Nature子刊《Nature Methods》杂志。
“冷冻电子断层成像术是可视化细胞内部结构的强大武器,其分辨率是世界上最高等级的光学显微镜的100倍,”文章通讯作者、贝勒医学院计算与整合生物医学研究中心副主任Steven Ludtke教授说。
目前,除非使用冷冻电子断层成像,其他任何手段都无法直接获取细胞内部进程信息,包括正常或疾病细胞微环境变化等。“然而,这项技术需要耗费大约1周手动工时才能完成一个细胞内部所有细节和结构的标注,这严重限制了技术的推广和使用,”Ludtke说。
为了提高效率,Ludtke和同事开发了自动化的方法便捷方法。用不同类型细胞(如人血小板、非洲锥虫、蓝藻等)进行测试,并与传统方法比较,结果显示新方法可以准确地确定细胞内部结构,并具有很高的精确度。
新技术极大地节约了科研工作者的劳动时间,从整整一周缩减到了1小时。应用软件包下载地址是“http://blake.bcm.edu/emanwiki/EMAN2/”点击链接,无需任何费用,还提供免费培训。
颜宁研究组在《Cell》发文报道Nav1.4与β1复合物三维结构
原文标题:Convolutional neural networks for automated annotation of cellular cryo-electron tomograms
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