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Science公布重要新突破:首次发现环状RNA的体内功能
【字体: 大 中 小 】 时间:2017年08月14日 来源:生物通
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近年来,环状RNA(circRNAs)已经成为了RNA领域最新的研究热点,但它们在活体生物中的作用依然是一个迷。最新一项研究报告称,一种环状RNA:Cdr1as能调控哺乳动物大脑中的microRNA水平,如果删除这种RNA,就会导致小鼠出现异常的神经元活动和行为障碍。
生物通报道:近年来,环状RNA(circRNAs)已经成为了RNA领域最新的研究热点,但它们在活体生物中的作用依然是一个迷。最新一项研究报告称,一种环状RNA:Cdr1as能调控哺乳动物大脑中的microRNA水平,如果删除这种RNA,就会导致小鼠出现异常的神经元活性和行为障碍。
这一研究成果公布在8月10日的Science杂志上。
美国布兰迪斯大学的一位circRNA研究员Sebastian Kadener(未参与该项研究)表示,“几乎很少有成果可以称得上是一项突破。这篇文章就是一项突破,令人激动,这是第一次真正证明动物体内这些分子的功能。”
CircRNA是近年来RNA领域最新的研究热点。它是前体RNA(pre-mRNA)通过一种叫做反向剪接反应(back-splicing)的特殊选择性剪接产生,在真核细胞中广泛表达的环形内源性RNA分子。尽管被低效地加工,大多数呈低水平表达,但研究发现一些circRNAs源自与人类疾病相关的基因组位点,而且有越来越多的证据表明它们在转录、转录后及翻译调控中的潜在作用。
Cdr1as是一种在哺乳动物大脑中大量表达的环状RNA,也是目前研究的最多的几种环状RNA之一。最早Cdr1as就是由德国MaxDelbrück研究中心的Nikolaus Rajewsky(本文作者)及其同事在2013年报道,他们指出这种分子可以作为miRNA的“吸收棉”,因为它有超过60个miRNA miR-7的结合位点,不过其具体作用依然不清楚。
之后的研究又发现Cdr1as能从DNA的反义链转录,并且没有多余的对应表达物,因此可以通过诸如CRISPR-Cas9之类的DNA编辑工具进行功能缺失型研究,“这非常吸引人,这样就能操控DNA,在功能水平上看到环状DNA缺失后的应答。”
在最新这项研究中,Rajewsky等人首先利用一种之前研发的技术发现了miRNAs和其它分子之间的体内相互作用。研究人员采用小鼠和人类死后大脑,结果表明miR-7,以及另外一种miRNA:miR-671(较少)都能与Cdr1as结合。
之后研究人员通过CRISPR-Cas9删去小鼠中的这一位点,获得了Cdr1as缺陷型突变体。虽然敲除动物从外表看是正常的——它们能动,能繁殖,并且在脑解剖学中都没有出现明显的变化,但是研究小组检测发现Cdr1a一般正常表达的大脑区域中游离miRNA表达水平发生了改变:miR-671略微增加了一些,而miR-7显著减少,这表明环状RNA的作用可能是阻止这种miRNA的降解,Rajewsky指出。
miRNAs在动物体内具有调节mRNA的作用,因此研究人员接下来分析了Cdr1as缺陷型动物中基因表达的变化。结果发现敲除小鼠中与大脑活性有关的,一组被称为“立早基因(immediate early genes)”的表达发生了改变。这种基因受到一系列外界刺激后会迅速并且短暂激活,研究人员发现其中几个是miR-7的靶标。
Rajewsky说:“我们知道,神经元活性的标志之一就是立早基因的上调。在敲除小鼠的大脑中,很清楚,立早基因都增多了”。
敲除小鼠出现了神经元活性的异常。此外单细胞分析还显示,与对照相比,敲除小鼠出现了超过两倍以上的微小兴奋性突触后电流频率,这是神经传递紊乱的征兆。
最后研究人员通过一系列实验,寻找Cdr1as缺陷造成的行为后果。虽然敲除小鼠表现出正常的焦虑水平,而且也没有明显的记忆缺陷,但研究人员发现它们在脉冲前抑制实验(prepulse inhibition experiments)中表现不佳,这是测量动物对厌恶刺激的惊吓反应的抑制能力。
Rajewsky解释说,如果人体的的这种机制受到损坏,通常会与神经精神障碍症如精神分裂症,Tourette综合征和强迫症产生关联,这提出了Cdr1as在行为中的最终作用。
斯坦福大学的RNA研究员Julia Salzman称这篇论文是“一项非常吸引人的重要研究,为该领域取得了巨大的进步”。
下一步Rajewsky团队计划分析在敲除小鼠中其它失调基因的作用,例如,Cdr1as缺陷型动物中一些昼夜节律基因的表达发生了改变。
科学家们认为,这项研究为研究Cdr1as和其它环状RNA在分子,神经和行为表型方面打下了基础,“虽然目前还不完善,但是这毕竟是第一次将这三者联系在一起。”
(生物通:万纹)
原文检索;
M. Piwecka et al., “Loss of a mammalian circular RNA locus causes miRNA deregulation and affects brain function,” Science, doi:10.1126/science.aam8526, 2017.