GWAS一次性斩获12个高癌风险位点

5个有关睾丸癌的主要课题组共同提供的一组数据分析指出了易受遗传性睾丸生殖细胞肿瘤影响的新遗传位点。研究人员称它为基因组图谱的又一成功故事。这项发现将帮助医生了解哪些人的患病风险最高，指导医生重点筛查这些人群。

　　

生物通报道：国际睾丸癌研究协会（The international Testicular Cancer Consortium，TECAC）的研究人员在宾夕法尼亚大学Perelman医学院转化医学和人类遗传学教授Katherine L. Nathanson医学博士的领导下，与多个机构展开合作，最终获得了今日发表在《Nature Genetics》上的研究成果。该论文的第一作者是Zhaoming Wang，他在美国国立癌症研究所Stephen J. Chanock医学博士的指导下工作。

睾丸生殖细胞肿瘤（testicular germ cell tumor，TGCT）占睾丸癌病例的95%。在美国和欧洲国家，TGCT是20岁到39岁男性最常见的癌症，在过去的20年间病例数逐年上涨。尽管有明显证据表明，该肿瘤的易感性来自遗传，但是人们还没有找到一个类似乳腺癌BRCA1突变的外显率高的睾丸癌致病基因。

在此背景之下，用于鉴定疾病风险相关常见变异的全基因组关联研究（genome-wide association studies，GWAS）在这项最新的突出研究之中大放光彩。

同期《Nature Genetics》的另一篇名为“Identification of 19 new risk loci and potential regulatory mechanisms influencing susceptibility to testicular germ cell tumor”（ 接收时间2017年5月16日）同属一个领域，但是后者的接收时间晚了19天，但是发现的基因变异总数比本文多7个。Nature Genetics同期两篇文章：GWAS和Hi-C技术解密全新癌症相关基因

Nathanson和她的研究团队使用GWAS分析术，发现了染色体上与TGCT风险增加有关的变异loci。他们结合了来自5个国际TGCT研究、将近3600个癌症病例的GWAS数据。

“我们发现了来自前所未知的染色体区域内的8个loci，”Nathanson说。“我们还发现了来自已知区域内的4个新loci。”

Nathanson指出，新位点的识别不仅仅具有统计层面意义，它们还具有生物学层面意义，暗示出特定途径的破坏，特别是涉及雄性生殖细胞发育、成熟和功能的途径。

“相比其他类型癌症，我们计算发现，TGCT的位点特异性遗传占比很高，但是loci位点数目较少。”

加上此次新鉴定的12个loci，目前已知的loci数目总数累计40个。Nathanson说，综合所有loci，大约37%的父亲传递给儿子的睾丸癌家族性风险将有据可循。

“尽管这种癌症可被治愈，但是此项新发现表明，关于这类特殊的疾病类型，我们仍需再接再厉，”Nathanson受。“基因组学发现可指导我们确定哪些病人处于高发病风险，哪些病人需要筛查，尤其对隐睾人群，精确的早期筛查更加有用。”

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原文标题：Meta-analysis of five genome-wide association studies identifies multiple new loci associated with testicular germ cell tumor