Nature头条：先发制人，扼住无声杀手的咽喉

由美国、加拿大、英国、巴西等多国科学家共同组成的项目团队，最近在《Nature》杂志报道了三篇有关寨卡病毒传播的隐藏路径的文章。通过深入了解遗传基因，科学家们对寨卡病毒的时空传播又有了新的认识。这项研究具有重大的公共卫生意义，很有可能是阻止未来寨卡病毒爆发的关键。

　　

生物通报道：寨卡病毒可造成大批婴儿脑发育不全。世界卫生组织（WHO）宣布，将寨卡病毒及小头症列为全球紧急公共卫生事件，国际社会应当协调应对。这是继甲型H1N1流感、脊髓灰质炎及埃博拉疫情后，世卫组织发布的第四个国际关注的突发公共卫生事件。中国疾病预防控制中心已掌握寨卡病毒的检测方法（便携式寨卡病毒快速检测技术），并将与外交、商务、质检、公安、旅游等部门合作，进一步做好疫情防范和应对准备工作。国家卫计委提醒，随着气候逐渐回暖，到了春夏季后，广东等南方省份需要格外警惕，建议孕妇推迟前往拉丁美洲。

自世界卫生组织（WHO）发出寨卡病毒流行警报（2016年2月）后，目前寨卡病毒的流行病学和进化时间表仍是一片空白。研究人员驾驶着小型面包车一路走访了2000多公里的巴西东北部疫情区，他们手持先进的便携移动DNA测序仪，对1300多名感染者做了基因检测。

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通过基因组测序了解病毒的基因组成，科学家们追踪到了寨卡在巴西的传播情况。这项研究结果表明，寨卡起源于巴西（拉丁美洲）境内，在美国（北美洲）发现了首例寨卡感染（2016年初）之前，寨卡就已经开始向世界各地蔓延。

牛津大学动物学系的Nuno Faria博士说：“数百万人已经感染，可是我们手头的病毒基因组资料却寥寥无几。越早掌握这种悄无声息的致命病毒的遗传多样性，方可在病毒全面爆发之前开发出有效的预防疫苗。同时，我们需要根据病毒传播的途径，预测哪里最需要疫苗，以及疫苗的需求量。”

Oliver Pybus教授说：“通过我们最近掌握的病毒基因组，我们构建了寨卡病毒的美洲流行病史，我们首次发现了如今在巴西到处流窜的寨卡的具体发现时间——2015年5月。”

“我们还发现，作为大多数寨卡感染病例和小头畸形婴儿高发区域的巴西东北部，是寨卡病毒在巴西主要城市之间流行的联系纽带。”

在人类、蚊子、和病毒基因组测序之旅中，研究人员从北美洲到巴西，一路边走边测序取样，高强度地使用了多种检测手段：人类和昆虫RNA提取（RNAeasy kit，QIAGEN 索取Qiagen基因表达分析的完整解决方案），病毒定量 （索取qiagen 使用qPCR进行mRNA和非编码RNA的表达分析在线讲座视频），寨卡病毒RNA-seq和cDNA测序（索取Illumina NeoPrep文库制备系统的详细技术资料，索取2017年Illumina最新测序系统NovaSeq的详细参数资料！），多方比对确认全基因组测序结果（ThermoFisher），系统发生分析等等。其中，由牛津大学衍生企业开发的，重量不足100g的便携DNA测序仪MinION，在越野实地取样中发挥了重大作用。

寨卡病毒基因多样性分析

蚊子和环境DNA测序分析

赛默飞助力完成两例寨卡病毒全基因组序列测定

伯明翰大学的生物学教授Nick Loman说：“在人类与传染病的对抗赛中，基因组测序无疑是人类能仰仗的最强大的武器，然而，直接从临床标本中分离寨卡病毒对科研人员来说是项艰巨的挑战。这些新开发的实时基因组测序方法对管理病毒和控制病毒爆发具有非常重要的意义，因为它们能使我们真实地了解病毒的传播和进化。使用手提纳米孔测序仪，使我们在疫区的检测更加迅速。这项技术，同样适用于在全球各地进行科考的其他病毒学家。”

作为一个国际间的合作项目，目前该项研究的数据结果已经共享在三篇《Nature》在线期刊（DOI: 10.1038/nature22400，DOI: 10.1038/nature22401，DOI: 10.1038/nature22402），以方便全球研究人员下载研究。文中所报道的病毒传播地图，对将来的病毒流行趋势快速预报和相关政策制定具有潜在的指导意义。

原文标题：
1.Genomic epidemiology reveals multiple introductions of Zika virus into the United States
2. Establishment and cryptic transmission of Zika virus in Brazil and the Americas
3.Zika virus evolution and spread in the Americas