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DNA的另类功能:将操作系统、电影编辑到DNA中
【字体: 大 中 小 】 时间:2017年03月06日 来源:生物通
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DNA是储存数字信息介质,出于对DNA这一属性的兴趣,哥伦比亚大学的Yaniv Erlich和Dina Zielinski研究员创建了一种在DNA中储存数码信息的方法。
生物通报道:DNA是储存数字信息介质,出于对DNA这一属性的兴趣,哥伦比亚大学的Yaniv Erlich和Dina Zielinski研究员创建了一种在DNA中储存数码信息的方法。
DNA的强大信息储存能力是毋庸置疑的。然而,现有的方法仅开发了其理论值的一小部分。 Erlich和Zielinski提出了“DNA喷泉(DNA Fountain)”的方法,使每个核苷酸的信息储存能力接近理论最大值。通过实验证明,他们有效地在一个2.14×106字节的DNA寡核苷酸链中,重现一个完整的计算机操作系统、电影、以及其他文档。
通过使用相当于单一的Illumina测序的DNA排序,将数据信息储存进去,然后再利用原始DNA样品进行2.18×1015的检索,能够完全解码这些数据。最后,两位研究员还讨论了,在他们的计算结构下,以字节为单位的,每个分子的容量限制,然后,从密度为每克DNA 215PB字节的情况下,依旧得到了一个很好的检索效果,高于以前的报道(DNA储存能力仅约为半个香农信息论预测的理论储值)。
DNA喷泉依赖于一种编码技术。在这种技术中,信息被随机封装,并接着被有序地组装,过程类似于互联网运作。为了将错误降至最低,该系统会优选高品质的寡核糖苷酸,而非受损的寡核糖苷酸。因此,如果有某些寡核苷酸丢失或受损,所储存的信息仍然可被表达。文章作者用DNA喷泉来编码一个有2,146,816字节(储存密度为理论上线的14%)的单一压缩文件,并将它储存到DNA内,该压缩文件代表了一个完整的图形操作系统、一部电影、和其他文件。他们成功地检索到了完整的信息集。随着寡核苷酸的复制,错误也可能会增加,尽管如此,DNA喷泉仍然可以通过寡核苷酸的多轮复制,完整地修复文件。
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(生物通:欧阳沐)
原文标题:DNA Fountain enables a robust and efficient storage architecture