Nature Methods:细胞生物学中的那些“假象”

【字体: 时间:2016年06月17日 来源:生物通

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  现在,超高分辨率显微技术已经成为了研究细胞膜蛋白的常用方法。许多研究团队发现自己研究的蛋白在细胞膜中形成了簇,TU Wien的研究人员也遇到了这样事儿。不过他们最近在Nature Methods杂志上发表文章指出,这些所谓的蛋白簇其实往往是一个闪烁的分子,只不过在超高分辨率显微成像的时候计算了多次。

  

生物通报道:几个世纪以来,光学显微镜的“衍射极限”一直被认为是无法超越的。近年来,科学家们从不同途径“突破”了这一极限,使人们能够分辨相距少于200nm的两个物体。这些超高分辨率显微技术也因此获得了2014年诺贝尔化学奖。

现在,超高分辨率显微技术已经成为了研究细胞膜蛋白的常用方法。许多研究团队发现自己研究的蛋白在细胞膜中形成了簇,TU Wien的研究人员也遇到了这样事儿。不过他们最近在Nature Methods杂志上发表文章指出,这些所谓的蛋白簇其实往往是一个闪烁的分子,只不过在超高分辨率显微成像的时候计算了多次。他们还找到了鉴别真正蛋白簇的简单方法。

“对于医学和生物学的许多重要问题而言,了解细胞膜结构是至关重要的,”文章第一作者Florian Baumgart说。“超高分辨率显微镜是研究细胞膜上蛋白质空间排布的理想工具。我们针对T细胞进行了研究,T细胞能够识别抗原,在免疫系统中起到了重要作用。”

研究显示,改变荧光团(fluorophore)的浓度可以有效分辨真正的蛋白簇和闪烁的单个蛋白。增加荧光标记的量,真正的蛋白簇就会展现出越来越多的分子位点,但蛋白簇之间依然是黑暗。但如果是随机分布的蛋白,增加的荧光分子最终会覆盖整个表面,不会在任何区域形成簇。这种简单策略可以帮助研究者们正确解读超高分辨率的成像数据,有望成为理解细胞膜结构的重要方法。

目前主要的超高分辨率技术包括:光激活定位显微技术PALM、随机光学重建显微技术STORM、受激发射损耗STED,结构照明显微技术SIM和RESOLFT。霍华德•休斯医学研究所HHMI的研究团队在Science杂志上发表了一项重要的技术突破。他们大大提升了结构照明显微技术(SIM)的空间分辨率,在活细胞中空前清晰地成像了动态的生物学过程。诺贝尔奖得主Eric Betzig和华人博士后Dong Li在这项研究中,通过视频展示了细胞内结构蛋白的重塑,以及细胞摄入分子时的膜动态。(更多信息请参见:诺奖得主和浙大学子Science发表重要技术突破

超高分辨率显微技术需要昂贵的专业仪器,而且在厚样本中效果并不那么理想。去年年初,MIT著名学者Edward Boyden和同事在Science杂志上发布了用常规显微镜实现超高分辨率成像的膨胀显微技术(expansion microscopy,ExM)。该技术利用吸水膨胀的聚合物放大组织样本,操作非常简便,成本也很低。(更多信息请参见:Science:低成本的超高分辨率成像

最近,膨胀显微技术在实践中证明了自己的价值。华盛顿大学的研究团队在Nature Methods杂志上发表文章,证实膨胀显微技术能够取得理想的成像效果。他们还开发了将荧光连在多聚体上的新方法,让这种技术能够使用传统的荧光抗体和荧光蛋白。这项研究显著简化了膨胀显微技术的操作步骤,大大拓展了可用的荧光标记。膨胀显微技术由此取得了重要技术突破,有望广泛应用到众多科研领域中。(更多信息请参见:Nature Methods发表重要技术突破

生物通编辑:叶予

生物通推荐原文:Varying label density allows artifact-free analysis of membrane-protein nanoclusters, Nature Methods

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