-
生物通官微
陪你抓住生命科技
跳动的脉搏
Nature发布癌症基因组研究重大发现
【字体: 大 中 小 】 时间:2016年05月04日 来源:生物通
编辑推荐:
迄今为止最大规模的乳腺癌全基因组测序研究,揭示出了与这一疾病相关的5个新基因,以及影响肿瘤生长的13个新突变标记。发表在《自然》(Nature)与《自然通讯》(Nature Communications)杂志上两篇研究论文的结果,还揭示出了存在于乳腺癌中的一些遗传变异以及它们出现在基因组中的位置。
生物通报道 迄今为止最大规模的乳腺癌全基因组测序研究,揭示出了与这一疾病相关的5个新基因,以及影响肿瘤生长的13个新突变标记。发表在《自然》(Nature)与《自然通讯》(Nature Communications)杂志上两篇研究论文的结果,还揭示出了存在于乳腺癌中的一些遗传变异以及它们出现在基因组中的位置。
维尔康姆基金会桑格研究所(Wellcome Trust Sanger Institute)的Serena Nik-Zainal博士领导分析了560个乳腺癌基因组;其中556个基因组来自于女性,另外4个来自于男性。这一国际合作涉及来自世界各地,包括美国、欧洲和亚洲的一些乳腺癌患者。
研究结果揭示出了更多关于乳腺癌的原因,并提供了证据证实乳腺癌基因组高度个体化。
每个人的癌症基因组是他们一生中获得的遗传改变的完整历史记述。随着个体从受精卵发育为成人,他们细胞中的DNA会一路收集遗传改变。这些因为人类的DNA在不断地遭受环境中一些事物的损害或是在细胞中受到磨损。这些突变会形成一些我们可以检测到的模式或突变标记,它们可提示我们一些有关癌症原因的线索。
Nik-Zainal博士研究小组在每位患者的肿瘤中搜寻了促进癌症生长的突变,并寻找了突变标记。他们发现携带BRCA1或BRCA2基因,因此罹患乳腺癌和卵巢癌风险增高的妇女,彼此之间整体癌症基因组图谱高度差异,且与其他的乳腺癌也非常的不同。这一研究发现可利用来更准确地对治疗患者进行分类。
Nik-Zainal博士说:“在未来,我们希望可以分析个体的癌症基因组,让我们能够鉴别出针对确诊乳腺癌的女性或男性最有可能取得成功的治疗。这朝着个体化的癌症医疗又近了一步。”
突变在乳腺癌基因组中的确切位置也很重要。
合作者、来自欧洲生物信息学研究所的Ewan Birney博士利用一些计算技术,分析了每个样品基因组中的遗传信息序列。他说:“我们知道遗传改变以及它们在癌症基因组中的位置可影响个体对癌症治疗的反应。多年来我们一直在试图弄清楚,不编码任何特定事物的一些DNA区域是否驱动了癌症发展。这项研究让我们第一次大规模地查看了基因组其余的区域,揭示出了一些乳腺癌产生的新原因,并为我们提供了一种意想不到的方式来确定发生于某些乳腺癌中的突变类型的特征。”
维尔康姆基金会桑格研究所所长、Sir Mike Stratton教授说:“所有的癌症都是在我们的一生中出现于我们细胞DNA中的突变所导致。寻找这些突变对于了解癌症的原因及开发改良疗法至关重要。这项庞大的研究极详细地检测了560个基因组中每一个的数千种突变,让我们朝着完整地描述乳腺癌中的DNA改变,由此全面地了解这一疾病的原因,及获得开发新疗法的机会更近了一步。”
此外,发表在2016年1月14日Cell杂志上的一项研究也对乳腺癌细胞功能进行了一次迄今为止最大规模的分析调查,指出了数十个现有药物的新用途,一些药物发现新靶点及新的药物组合作者们说,研究结果可供全世界的实验室利用来鉴别其他类型癌症中的新候选药物及阐明癌细胞抵抗治疗的机制(Cell发布史上最大规模乳腺癌研究成果 )。
在癌症中,一些细胞信号通路是能够阻碍或加速疾病进展的一连串关键事件。由德克萨斯大学MD安德森癌症中心的科学家们领导的一项多机构国际研究,揭示出了有关长链非编码RNAs(lncRNA)与在许多癌症中过度表达的一种信号通路HIF-1之间如何互作的新信息。这项在线发表于Nature Cell Biology杂志上的研究,探讨了HIF-1在一种难治性侵袭性乳腺癌:三阴性乳腺癌(TNBC)中的作用(华人学者Nature子刊揭示三阴性乳腺癌治疗靶点 )。
波士顿大学医学院(BUSM)的研究人员近期确定了一个基因,在乳腺癌到转移性疾病的发展过程中发挥作用,可以帮助预测疾病的进展,并作为为未来乳腺癌疗法开发的一个靶标。这些研究结果发表在2016年1月6日的PNAS杂志上(PNAS:新的乳腺癌转移抑制基因)。
(生物通:何嫱)
生物通推荐原文索引:
Nik-Zainal S et al. Landscape of somatic mutations in 560 breast cancer whole genome sequencesis published in Nature 2016 published on 2 May DOI: 10.1038/nature17676
Morganella S et al. The topography of mutational processes in breast cancer genomes is published in Nature Communications 2016 on 2 May DOI: 10.1038/10.1038/NCOMMS11383