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浙大细胞所:多组学关联分析鉴定耐多药结核病血清标志物
【字体: 大 中 小 】 时间:2016年02月02日 来源:联川生物
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浙江大学细胞生物学研究所李继承教授领衔的课题组采用iTRAQ标记结合2D LC-MS/MS,以及Solexa测序对MDR-TB患者,药物敏感结核病(DS-TB)患者,和健康对照组血清中的蛋白质组和miRNA组进行了比较分析,鉴定出MDR-TB诊断的潜在生物标志物。
肺结核(TB)的流行,特别是耐多药结核病(MDR-TB),已成为今天结核病治疗的一个重大挑战。浙江大学细胞生物学研究所李继承教授领衔的课题组采用iTRAQ标记结合2D LC-MS/MS,以及Solexa测序对MDR-TB患者,药物敏感结核病(DS-TB)患者,和健康对照组血清中的蛋白质组和miRNA组进行了比较分析,鉴定出MDR-TB诊断的潜在生物标志物。相关研究工作发表在1月刊的International Journal of Biological Sciences。
相比于DS-TB患者和健康对照组,课题组在MDR-TB患者血清中共鉴定出50个差异表达蛋白质和43个差异表达miRNAs(差异倍数>1.50或<0.60,P值<0.05)。研究人员发现22%的差异表达蛋白质和32.56%差异表达miRNAs是相关的,可以构建一个主要为补体系统的网络。在MDR-TB患者,DS-TB患者,和健康对照组中,CD44抗原(CD44),凝血因子XI(F11),激肽原1(KNG1),miR-4433b-5p,miR-424-5p,和miR-199b-5p存在显著差异表达。这个结果已被ELISA和SYBR Green qRT-PCR所验证。与靶基因预测一致,miR-199b-5p与KNG1存在显著负相关(r=-0.232,P=0.017)。此外,研究人员还建立了基于5个标志物(CD44,KNG1,miR-4433b-5p,miR-424-5p,和miR-199b-5p)的MDR-TB诊断模型。在本项目中,联川生物协助课题组完成了血清miRNA测序分析,miRNA测序数据和蛋白质组定量数据关联分析的工作。
本研究提出了MDR-TB诊断的潜在生物标志物,并提供了一个新的理解MDR-TB发病机制的实验基础。
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参考文献
Wang C, Liu CM, Wei LL, Shi LY, Pan ZF, Mao LG, Wan XC, Ping ZP, Jiang TT, Chen ZL, Li ZJ, Li JC. A Group of Novel Serum Diagnostic Biomarkers for Multidrug-Resistant Tuberculosis by iTRAQ-2D LC-MS/MS and Solexa Sequencing. Int J Biol Sci 2016; 12(2):246-256. doi:10.7150/ijbs.13805.
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