首个包含230万种物种的生命之树发布

　　

——研究人员绘制出了一张包含230万种物种的单一系统发育关系图

生物通报道：来自佛罗里达大学的研究人员将之前绘制的484张不同物种系统发育树拼凑在一起，创造了迄今为止最全面的生命之树，这一进化树包含有230万种已知的物种，这一研究成果公布在9月18日的《美国国家科学院院刊》（PNAS）杂志上。

领导这一研究的是世界知名的植物学家Douglas E. Soltis教授，他曾任国际科学基金会科学顾问和美国植物学会会长，主要从事有花植物和陆生植物的物种形成机制、进化关系和性状进化研究，在被子植物系统发育、形态演化、多倍化引起的遗传和基因组变异及稀有物种的保护遗传研究中取得了突出成绩。同时Soltis教授也受聘于中科院植物研究所外籍特聘研究员。

Soltis教授希望这项最新的成果能为多个科研领域提供新的信息，比如药物研发，气候变化调查，以及传染疾病。“这是了解物种之间如何发生关联的最基础和重要的知识了，这个生命之树具有预测能力”，他说。

不过目前新版的进化树还只是初稿，文章的另外一位作者，来自杜克大学的Karen Cranston 表示，“这是首次真正尝试将这些关联点连接在一起，我们可以将其看成是1.0版本。”

Soltis也表示，“这个生命之树还只是起点，大多数物种之间关系主要基于DNA数据，然而地球上这么多物种中，只有不到5%的物种实际可获得DNA数据。而且这其中也存在许多我们尚未知晓的多样化……数以百万的物种依然未被发现，我希望这个第一张图谱能吸引更多人来研究生物多样性，因为只有通过兴趣和进一步的努力，这一生命之树才能继续生长。”

Soltis教授一直尝试利用植物进化的相关信息为科研提供更多资料，此前其研究组就通过研究指出，某些植物可能无法迅速适应未来气候变化。

他们利用开花植物进化树数据，提出了植物是如何逐渐具备抗拒低温的特性的，并指出，人类活动对植物和全球的农业造成的威胁可能被原来想象的还要大。

研究者发现，这些植物在进入更加寒冷的地区之前，可能已经获得了某些适应低气温的特性。而某些现代的被子植物，包括大多数开花植物、树和农作物，可能都不具备迅速应对人类活动导致的气候变化的特性。

（生物通：万纹）

原文摘要：

Synthesis of phylogeny and taxonomy into a comprehensive tree of life

Reconstructing the phylogenetic relationships that unite all lineages (the tree of life) is a grand challenge. The paucity of homologous character data across disparately related lineages currently renders direct phylogenetic inference untenable. To reconstruct a comprehensive tree of life, we therefore synthesized published phylogenies, together with taxonomic classifications for taxa never incorporated into a phylogeny. We present a draft tree containing 2.3 million tips—the Open Tree of Life. Realization of this tree required the assembly of two additional community resources: (i) a comprehensive global reference taxonomy and (ii) a database of published phylogenetic trees mapped to this taxonomy. Our open source framework facilitates community comment and contribution, enabling the tree to be continuously updated when new phylogenetic and taxonomic data become digitally available. Although data coverage and phylogenetic conflict across the Open Tree of Life illuminate gaps in both the underlying data available for phylogenetic reconstruction and the publication of trees as digital objects, the tree provides a compelling starting point for community contribution. This comprehensive tree will fuel fundamental research on the nature of biological diversity, ultimately providing up-to-date phylogenies for downstream applications in comparative biology, ecology, conservation biology, climate change, agriculture, and genomics.