Cell公布最新基因组测序结果

　　

生物通报道：去年夏天西非埃博拉爆发的早期阶段，科学家们以空前的规模和速度测序了这种致命病毒的基因组，为人们揭示了许多疫情蔓延的关键信息，比如说病毒只通过人与人接触传播，病毒在多次传播中获得了许多新突变等等。

虽然埃博拉爆发最糟糕的时期已经过去，但这场疫情并未结束，还有许多问题需要人们去解答。为此，哈佛大学、Broad研究所、美国疾控中心（CDC）、美国国家过敏和传染病研究所（NIAID）等研究机构测序了两百多个埃博拉病毒样本的基因组，进行了迄今为止最全面的分析。这项研究发表在六月十八日的Cell杂志上，展示了病毒在这么长时间里发生的改变。

“我们之前的工作反映了埃博拉爆发后三周的病毒行为，”文章的资深作者Sabeti说。“现在这项研究跟踪了病毒在七个月内的变化，有助于理解埃博拉的长期演化。”

“这些高分辨率的测序数据显示，在埃博拉疫情爆发的后期，病毒跨境传播是非常少的，”文章第一作者Danny Park指出。“这是一个重要的信息，因为塞拉利昂、利比里亚和几内亚（三个受疫情影响的主要国家）的国境被认为是千疮百孔的。”

跨境行为在埃博拉爆发初期推动了疫情的发展，但后来病毒并没有像人们预测的那样迁移，Park说。“在国境上实施的控制措施的确有效，这是令人欣慰的好消息，”他说。“人们也应当把关注国内的迁移行为。”

研究人员通过测序分析了埃博拉在持续性爆发中出现的演化。随着病毒在早期阶段快速扩散，它们累积了许多突变，其中有不少可以影响蛋白质功能。去年的测序研究表明，这些突变大多对病毒是有害的，但当时疫情持续的时间还不长，不足以通过自然选择将其清除。（延伸阅读：最新Science公布埃博拉病毒基因组测序结果）

现在研究人员看到，许多突变并没有存留多久，病毒的基因组变化速度符合人们的预期。“这一次埃博拉在人类中传播得最久规模也最大，它已经开始清除对自己不利的突变了，” Park说。

这项研究还证实了人们的一些其他推测，比如说有患者体内出现了人类酶编辑病毒基因组的现象。这是首次在埃博拉中发现这类事件，该事件一般只出现在和人类长期互作的病毒中。

 

生物通编辑：叶予

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