Cell子刊：解读细胞命运的新工具

　　

生物通报道：荷兰Leiden大学的科学家们开发了一个新工具，可以通过比对未成熟干细胞与人类胎儿细胞的基因表达，确定这些干细胞的分化潜能。他们在五月二十八日的Stem Cell Reports杂志上发布了这个被命名为KeyGenes的平台。

现在研究者们只需要分析基因活性，就可以预测自己的细胞能发展成什么样的器官或组织。此外，KeyGenes还可以用来测试干细胞移植物的质量。

“确定细胞的身份，是干细胞生物学中最大的困难之一，”文章的资深作者，Leiden大学医学中心的Susana Chuva de Sousa Lopes说。“KeyGenes有助于开发更好的分化方案，让我们获得的细胞更类似于活体细胞。”

美国的研究团队去年夏天也发布了一个类似的平台，CellNet。CellNet是将组织与芯片数据进行比较，以此评估分化为人类成体组织的方案。KeyGenes主要以基因表达为基础，该平台整合了人类胎儿和成体组织的数据，会为细胞给出评分。（延伸阅读：两篇Cell文章：为干细胞医学提供指南）

“我们在人类胎儿发育过程中收集了大量的基因表达数据，涵盖了多个器官和不同发育阶段。KeyGenes能够鉴定人类干细胞衍生物的身份，并且评估其正确的发育年龄，”文章的共同作者，Leiden大学的Christine Mummery说。

研究人员指出，KeyGenes用于临床可以找到发育过程中出现异常的组织。这个工具还可以帮助人们更好的分化患者干细胞，用于移植或者药物测试。

KeyGenes还为研究者们揭示了决定细胞命运的基因。这些基因主要是转录因子，以及与细胞粘附和形态有关的基因。“KeyGenes识别的还有长非编码RNA，说明这类分子的确起到了重要的作用，”Lopes说。

Lopes等人目前正在测试更多的细胞类型和器官。他们还公开了KeyGenes平台，让广大研究者们可以免费使用。Lopes打算最终将表观遗传学数据整合到这个平台中，阐明干细胞是否残留有表观遗传学记忆，以及这些记忆是否会影响细胞分化的能力。

 

生物通编辑：叶予

生物通推荐原文：

Stem Cell Reports, Roost et al.: "KeyGenes, a tool to probe tissue differentiation using a human fetal transcriptional atlas"