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Affymetrix推出全新Axiom™ Analysis Suite,一款全自动基因分型工具
【字体: 大 中 小 】 时间:2015年04月30日 来源:Affymetrix
编辑推荐:
Axiom™ Analysis Suite融合了Genotyping Console™ Software和SNPolisher软件的强大功能,提供了集成、单源的软件包,可实现所有Axiom® 芯片的完整基因分型分析,适合人类研究和农业基因分型应用。
亲爱的顾客:
我们在此通知您,Affymetrix用于基因分型分析的最新软件包——Axiom™ Analysis Suite现在上市了。您收到这个新软件包的通知,是因为您之前下载过Genotyping Console™ Software。
Axiom™ Analysis Suite融合了Genotyping Console™ Software和SNPolisher软件的强大功能,提供了集成、单源的软件包,可实现所有Axiom® 芯片的完整基因分型分析,适合人类研究和农业基因分型应用。
该软件可从新的Axiom™ Analysis Suite产品页面上获取。进一步了解Axiom基因分型方案在人类疾病研究和农业基因分型中的应用。
Axiom™ Analysis Suite的特征与优势:
Axiom™ Analysis Suite在一个简单易用的图形界面上集合了单核苷酸多态性(SNP)基因分型、插入/缺失(indel)检测,以及简单和复杂基因组中的脱靶变异(OTV)检出
• 一键式分析:最佳实践流程如今可通过一个按钮完成,并提供了样品和反应板QC、基因分型分析,以及SNP聚类成簇,它们被定义成容易观察的类别
• 自动分类SNP:Axiom Analysis Suite能够将每个SNP分类到簇,便于轻松解释,并防止基因型检出的错误解释
• 自定义视图:使用默认或自定义的视图来查看结果,审核反应板水平的QC热图和箱形图,通过箱形图和散点图评估样品性能,并查看单个SNP的聚类图
• 自定义的分析配置:现在可以导入样品文件,选择分析配置的设置,并在New Analysis配置窗口设置QC阈值
• 多倍体和二倍体物种的高级分析功能:Axiom analysis suite提供了自定义分析设置的功能,如inbred penalty,以便对自交系植物进行基因分型,并对有着复杂基因组的物种应用补充过滤器
• 编辑基因型的能力:编辑和更改基因型的套索功能
• 多种输出格式:结果可导出为流行的格式,如PLINK和VCF
与Axiom™ Analysis Suite兼容的库文件:
• 目录芯片的库文件可直接通过Axiom™ Analysis Suite下载;安装文库文件的指南详见Axiom Analysis Suite的用户指南
• 关于所有自定义库文件的帮助,请联系全球产品支持(GCO-GPS@affymetrix.com)或生物信息学服务(bioinformatics_services@affymetrix.com)