外周血循环exosome lncRNA测序

exosome来源于晚期核内体(也称为多囊泡体)的囊泡，是由活细胞分泌的而来，是一类大小介于30-100nm的含有RNA和蛋白质的微囊，几乎所有类型的细胞都能分泌，广泛存在于各种体液中，特别是存在于外周血循环系统。目前的研究发现外周血循环exosome包含有蛋白质、脂质，还有种类丰富的各类核酸分子，特别miRNA、piRNA和lncRNA。这些核酸分子被exosome的脂膜所包裹和保护，在细胞间通信中发挥重要的生物学功能，并有望成为液体活检的重要分子标志物。

 
外周血循环RNA存在形式示例图

锐博生物在全球领先研发出外周血循环exosome RNA富集和提取技术，并结合微量RNA建库测序技术，提供外周血循环exosome lncRNA研究整体解决方案，为广大的生物医学研究提供最前沿和高质量的技术服务。
通过exosome lncRNA测序技术，具有以下医学意义：

• 开发针对复杂疾病的无创早期检测标志物，提高诊断的特异性和灵敏性；
• 指导针对复杂疾病特别是肿瘤的个性化治疗；
• 用于疾病的预后判断，特别是循环系统疾病和肿瘤

服务流程

测序方案

1) 测序平台：Illumina HiSeq 3000/2500
2) 测序模式：PE150/PE100
3) 测序数据量：每个样本10G clean data
适用物种：人、大鼠、小鼠
样本类型：血清或血浆

分析内容

1. 去除接头序列及低质量reads的处理
2. 测序质量评估
3. 参考基因组比对
4. 全基因组reads分布图谱
5. RNA均一性分析
6. RNA序列完整性分析
7. mRNA一：已知mRNA鉴定
8. mRNA二：mRNA表达量计算及样品间表达差异分析
9. mRNA三：差异基因KEGG生物通路富集分析
10. mRNA四：差异基因GO功能富集分析
11. lncRNA一：已知lncRNA鉴定
12. lncRNA二：计算已知lncRNA表达量及样品间lncRNA表达差异分析
13. lncRNA三：预测新lncRNA
14. lncRNA四：计算新lncRNA表达量及样品间新lncRNA表达差异分析

锐博实测数据展示

实测样本：某份人血清exosome lncRNA

检测结果中：
编码基因约7000个；lncRNA基因约3000个；
mRNA转录本约10000个，lncRNA转录本约5000个
新lncRNA检测：可检测出超过2000新lncRNA转录本

基因完整度检测：横轴为转录本度覆盖度，纵轴为转录本所占比例

转录本覆盖均一性/偏好性检测
说明：reads在转录本上分布较为均一，无3’或5’偏好性

了解外周血循环exosome lncRNA研究方案