何奕騉、朱健康等发表重要基因组测序成果

【字体: 时间:2015年04月22日 来源:生物通

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  牛耳草(Boea hygrometrica)是一种重要的复苏植物。日前,首都师范大学、中科院、华大基因和密苏里大学的研究人员通过测序获得了1.69 Gb的牛耳草基因组草图。这一重要成果发表在四月二十日的美国国家科学院院刊PNAS杂志上。

  

生物通报道:“Drying without dying”是陆生植物演化出的一种重要特性。具有这种特性的复苏植物能够忍受极端干旱,在水分适宜时又可恢复正常生长。由于缺乏基础的基因组信息,人们并不了解复苏植物如何在叶片和根系脱水的情况下生存下来。

牛耳草(Boea hygrometrica)是一种重要的复苏植物。日前,首都师范大学、中科院、华大基因和密苏里大学的研究人员通过测序获得了1.69 Gb的牛耳草基因组草图。这一重要成果发表在四月二十日的美国国家科学院院刊PNAS杂志上,文章的通讯作者是首都师范大学的何奕騉 (YiKun He)教授、中科院的朱健康(Jian-Kang Zhu)研究员和密苏里大学的Melvin J. Oliver。(延伸阅读:首都师范大学何奕騉教授PNAS发表新成果

这是人们首次测序极端耐脱水的植物,牛耳草的基因组序列将提供重要线索,帮助人们理解复苏植物强悍的生存能力。这项研究是耐旱研究领域的一大进步,也是一个备受期待的资源,将在植物生物学和农业的多个领域产生深远的影响。

研究显示,牛耳草基因组在进化过程中经历了两次全基因组加倍。牛耳草基因组含有49,374个蛋白编码基因,其中29.15%是牛耳草独有的基因,20%的基因在转录水平上对干燥脱水有显著的应答。研究人员还发现,在脱水过程中保护光合机构以及快速恢复蛋白合成的能力,对牛耳草复苏非常重要。此外,牛耳草转录组还存在广泛的可变剪切。研究指出,这种植物的复苏能力主要是通过脱水应答基因的调控改变演化出来的。

作者简介:

何奕騉 理学博士,教授,博士生导师 首都师范大学副校长

2008.11 - 迄今:首都师范大学副校长;1998.6 - 迄今:首都师范大学生命科学学院,教授(1999-2009期间担任生物系系主任/院长);2002.1 - 2003.6:美国杜克大学(DCMB/Biology, Duke University, USA),访问学者;1999.7-1999.10:日本STA Fellowship资助,“日本岩手生物技术研究中心”客座研究员;1996.2 - 1998.9:中科院遗传所“负压室” (现“植物基因组国家重点实验室”) 804组,博士后;1992.9-1995.12:东北师大“细胞与遗传研究所”博士(植物细胞遗传方向);1985.9 - 1988.7:东北师大生物系,硕士(植物细胞工程方向);1982.2 - 1992.7:南充师范学院生物系,助教、讲师、副教授;1978.3 - 1982.2:南充师范学院(现: 西华师范大学)生物系,学士

朱健康 顶尖****/研究员,中科院上海植物逆境生物学研究中心主任、研究组长、博士生导师

1983-1987, 中国, 北京农业大学 土壤农业化学 获学士学位;1987-1990, 美国, 加州大学河滨分校 植物学 获硕士学位;1990-1993, 美国, 普度大学 植物生理学 获博士学位;1994.6 美国, 洛克菲勒大学 分子生物学 博士后;1995-1996, 美国, 奥本大学植物与微生物学系 助理教授;1996-1998, 美国, 亚利桑那大学植物科学系 助理教授;1999-2000, 美国, 亚利桑那大学植物科学系 副教授;2000-2003, 美国, 亚利桑那大学植物科学系 教授;2004-2006, 美国, 加州大学河滨分校植物学与植物科学系 特聘教授, 研究所所长;2007-2010, 美国, 加州大学河滨分校植物学与植物科学系 Jane Johnson讲座教授;2009.07-2011.06, 沙特, KAUST大学植物逆境基因组中心 主任;2010-至今, 美国, 普度大学生物化学与园艺及园林系 杰出教授;2011.7-至今,中科院上海生命科学研究院 研究员 顶尖****

 

生物通编辑:叶予

生物通推荐原文:The resurrection genome of Boea hygrometrica: A blueprint for survival of dehydration

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