四篇Nature子刊：人类基因组可以去掉一千个基因？

　　

生物通报道：Nature Genetics杂志三月二十五日连发四篇文章，展示了在同一个人群中进行的最大规模全基因组测序。冰岛deCODE公司的这个庞大测序项目不仅揭示了新的疾病风险基因和人类进化线索，还在人类基因组中鉴定了一千个似乎无关紧要的基因。

DeCODE全基因组研究是“一项壮举，”麻省总医院的人类遗传学家Daniel MacArthur评论道。“这在五年前根本无法想象。”

DeCODE公司成立于19年前，在经历了破产和重组之后，在2012年被Amgen公司收购。该公司旨在通过冰岛人的遗传和医疗数据寻找疾病基因，并在此基础上开发药物。虽然DeCODE没有拿到冰岛全国的健康记录，但它招募了323,000名志愿者，占冰岛人口的40%。

此前DeCODE已经发表过大量的研究，鉴定了与精神分裂症、糖尿病、癌症和其他疾病有关的遗传变异。这些成果大多是通过比较健康人和患者基因组得到的。

得益于基因组测序成本的直线下降，deCODE完成了2636名冰岛人的全基因组测序。这项研究揭示了一些会提高欧洲人阿尔茨海默症风险的疾病基因，包括ABCA7中的突变。之前也有研究找出了这个基因，但当时没有明确其中的高风险变异。此外，研究人员还评估了Y染色体的突变速度，这有助于在人类进化和迁移过程中确定关键事件的发生时间。

值得注意的是，DeCODE这项研究还发现了大量的人类基因敲除（human knockout）现象。人类基因敲除是指天然突变导致的基因失活，细胞不生产该基因所编码的蛋白。人类基因敲除可以帮助人们理解这些基因的功能，甚至找到新的药物靶标。（延伸阅读：Nature关注遗传学新动向：人类基因敲除研究）

研究显示，有超过8000名冰岛人携带着1171个敲除基因。许多这样的基因是冗余的，对人类生存和健康没什么影响。举例来说，有3%的敲除基因与气味分辨有关，这在远古时期可能有一定的影响，但对现代人来说却并不重要。当然，也有一些敲除基因值得进一步研究， 比如说与听力有关的敲除基因。DeCODE公司打算请一些缺乏功能基因的人进行临床检测，以便搞清楚这些基因的具体功能。

“这还只是冰山一角，”deCODE的CEO Kári Stefánsson说。Amgen公司肯定还保留了许多发现没有公布，“他们显然不会在文章中公布所有的信息，”MacArthur指出。

 

生物通编辑：叶予

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