奥巴马总统宣布启动2.15亿美元的精准医疗行动

　　

来自纽约的消息 – 美国总统奥巴马今天宣布启动2.15亿美元的精准医疗行动（precision medicine initiative），利用基因组学、信息学和卫生信息技术来加速生物医学新发现，希望能为美国的患者带来更加个性化的医疗。

这项公私合作的行动将包含在奥巴马总统下周公布的2016年预算提案中，计划为美国国立卫生研究院、美国国家癌症研究所、美国食品和药品管理局以及国家卫生信息协调员办公室提供新的资助。

这些资金将帮助那些机构开发超过100万人的全国自愿研究队列，从尽可能多的人中获得测序数据，确定癌症的基因组学驱动因素，改善新一代测序检测的评估和销售方式，在保护个人隐私的同时开发管理和分析大型患者数据集的方法。

“精准医疗正在超越目前这种一成不变的医疗方式，而是考虑个体在基因、微生物组、环境和生活方式上的差异，实现疾病的预防和治疗，”白宫科技政策办公室科学项目副主任Jo Handelsman在昨天的一个新闻发布会上表示。“我们的想法是为临床医生提供工具，以便更好地理解患者疾病背后的机制，并更好地预测哪些疗法将是最安全有效的。”

白宫表示，此行动的最大部分是为NIH提供1.3亿美元，以帮助开发超过100万人的全国研究队列，其数据 – 包括病历、遗传和代谢图谱、微生物组，以及环境和生活方式的信息 – 将有助于进一步了解疾病，并通过参与者和开放、负责的数据共享而建立一种开展研究的新方式。

此外，NCI将获得7000万美元的预算，以加大力度了解癌症的遗传基础，具体做法是扩展遗传方面的临床试验，探索癌症生物学的基本方面，并建立一个全国的“癌症知识网络”，产生并分享新的知识。

同时，1000万美元将预留给FDA，以帮助其获得更多的工具和专业知识，以便开发高质量的数据库，这些数据库将被用于评估新一代测序技术，并确保其用于患者的准确性、可靠性和安全性。

最后，此行动将在ONC上投资500万美元，以支持互操作性标准和要求的开发，保护患者的隐私，并实现系统之间数据的安全交换。

“精准医疗这一概念，也就是考虑个体差异的预防和治疗策略，并不是全新的，”NIH院长Francis Collins在发布会上谈道。“但是对于医学的许多方面，这种个性化一直都没有实现。我们知道的还不够。如今这有所改变，而且是以前所未有的速度，因此现在是时候启动这一行动了。”

Collins指的是过去几年在基础研究、数据科学、移动连接、电子病历使用上的发展，而“在规模上最引人注目的是DNA测序成本的下降。第一个基因组花费了4亿美元，而如今测序一个基因组的费用大约在1,000美元。过去15年内下降了超过10万倍。”

关于NIH创建超过100万名患者的纵向队列计划，Collins指出，该机构及其合作伙伴将不需要从头开始，可以利用目前公共机构和私人机构已经建立的研究队列。

“我们了解到目前大约有200个正在进行中的研究队列，至少有1万人参加，”Collins说。“他们从规模到已经收集到的信息来说是各不相同。但它们具有大量的潜力。”

Collins指出，此项研究队列工作中的很大一部分是尝试拼凑许多现有的队列，他表示这可以通过现有的项目（如电子病历和基因组学项目，eMERGE）来辅助。eMERGE旨在结合电子病历技术与DNA生物资源库，用在大规模、高通量的基因组学研究项目中。

至于可以被开发利用的现有队列类型，Collins提到了根据Kaiser Permanente的基因、环境和健康研究项目现已产生的队列的吸引人之处，它包括Kaiser系统在北加利福尼亚的43万名成年成员，并与加州大学旧金山分校合作产生的包含10万名个体的研究队列。不过，Collins强调NIH将鼓励新的参与者自愿帮助建立全国性的研究队列。

队列工作的另外一重要部分是尝试从尽可能多的参与者中获得测序数据。尽管近年来测序成本已大大降低，但行动中的这一部分仍是一个主要的障碍。

“我们也希望获得队列中所有参与者的全基因组序列[数据]，但费用必须要考虑，我们能从哪儿获得这些资金？”Collins说。尽管目前测序整个基因组的成本约为1,000美元，“不过曲线是下降的，这实际上比较让人放心，”Collins补充道。“当然，我们需要一定的时间来建立这个队列/群。我们的期望是，在组建队列/群的过程中，[测序]成本逐渐下降，因此最终目标是能够充裕地从尽可能多的群体人数中获得全基因组序列。”

全国队列项目的另一个重要方面是它的互动性。“精准医疗行动不仅仅是规模，”Collins说。“它还旨在成为一种新的研究模式，其中参与的人是真正的合作伙伴，不是对象，甚至不是患者，而是合作伙伴。”

为此，ONC正负责开发新的更好的方法，以确保患者同意下安全的数据交换，而这一行动也致力于保护患者的隐私。它推出了一个“多方利益相关者流程”，将听取患者组织、生物伦理学家、隐私和公民自由倡导者、技术专家及其他专家的建议来确定法律和技术问题。

总之，Collins指出尽管队列行动可能会在遥远的未来实现最大的好处，“在不久的将来应该能看到一些成功，特别是在癌症领域，这一领域被称为药物基因组学 – 即如何在正确的时间为正确的患者提供正确剂量的正确药物。这一行动将为了解如何在越来越多的人身上应用这一策略（即在正确的时间为正确的患者提供正确剂量的正确药物）提供一个绝妙的平台。”

在监管方面，FDA的局长Margaret Hamburg在发布会上指出，该机构的资助将主要用于改善它对新型精准医疗技术（特别是NGS）营销的监管方式。

“我们目前评估一项检测的分析和临床表现的方法是围绕一种检测-一种疾病的传统模式而设计的，”Hamburg谈道。“相比之下，新一代测序产生了海量的数据，可能与大量各种疾病，条件和风险因素相关，这一切利用新方法能更好地处理。”

她指出，FDA目前正在考虑这种方法是什么，并表示该机构已经安排在2月20日召开一次公开会议，讨论监管NGS技术所面临的挑战。在会议之前，该机构去年发表了一篇白皮书，提出其目前的想法，为未来的讨论打下基础。

Hamburg也指出，FDA在监管NGS技术上有一些经验：2013年12月，它批准了Illumina的MiSeqDx – 这是第一个获得此类批准的测序平台 – 以及两个相关的囊性纤维化检测。

正如Hamburg本周在加州山景城的世界个性化医疗大会上所讨论的，FDA采用一种“实际的方法”来评估MiSeqDx，她在昨天的发布会上重申了这一观点。

“关于分析性能，我们查看了仪器如何准确地测序基因组内一组有代表性的遗传变异，而不是要求每个可能变异的数据，”她说。“这样做避免了数年的数据收集，不会耽误公众享受到此技术的好处，同时也保证了它的准确性和可靠性。”

她指出，该机构采用了一种相似的方法来评估囊性纤维化的检测。“我们没有要求[Illumina]收集新的独立数据，支持每个突变与疾病相关联，以便证明其临床表现，”她说。相反，Illumina能够通过引用“大量组织化的囊性纤维化突变共享数据库”而利用现有的信息，这个数据库是指约翰•霍普金斯大学组织的囊性纤维化变异数据库。

“这个数据库的确是患者参与的一种模式，因为它是在囊性纤维化基金会的支持下建立的，”Hamburg指出。利用这笔资金，FDA打算“推进高质量、组织化数据库的发展，类似于Illumina两个囊性纤维化检测的审查中所使用的那个，”她说。