周琪，杨运桂，王秀杰三课题组获细胞重编程研究重要突破

　　

　真核生物的RNA分子上可发生100多种修饰，其中腺嘌呤第6位氮原子上的甲基化修饰(N6-methyladenosine, m6A)是高等生物mRNA上含量最为丰富的修饰。m6A修饰参与调控mRNA的剪接、运输、稳定性和翻译效率等。并且与肥胖和肿瘤等多种生理功能异常及疾病相关。但受到研究方法的限制，关于m6A修饰的研究长期进展缓慢。

   m6A修饰主要发生在 mRNA上RRACH序列中的腺嘌呤上，由RNA甲基转移酶复合物METTL3/METTL14/WTAP催化形成，并可被去甲基化酶ALKBH5和FTO移除。但细胞内只有部分mRNA上RRACH序列中的腺嘌呤会产生m6A修饰，这种特定m6A修饰形成位点是如何确定的，以及m6A修饰是否影响细胞重编程尚属未知。

　　在中国科学院“干细胞与再生医学”先导专项的支持下，中科院动物研究所周琪课题组、中科院北京基因组研究所杨运桂课题组、中科院遗传与发育生物学研究所王秀杰课题组通过合作研究，整合各自在干细胞、RNA修饰和高通量数据分析方面的研究优势，绘制了小鼠胚胎干细胞 (ESC)、诱导多能性干细胞 (iPSC)、神经干细胞 (NSC)和睾丸支持细胞 (SC) 转录组的m6A修饰图谱，发现了m6A修饰在多能与分化的细胞系间的分布差异，和发生在一些决定细胞特异分化的RNA分子上的细胞类型特异的m6A修饰。

    研究发现m6A修饰区域富集的特征序列具有与重要的调控非编码RNA ¾microRNA的种子区 (5’2-8 nt) 序列互补配对的偏好性。多层次的细胞与分子生物学实验证明，microRNA可以通过序列互补的方式，引起mRNA相应位点区域m6A修饰的产生。提高m6A修饰水平可以提高Oct4等关键多能性调控基因的表达量，促进小鼠成纤维细胞重编程为诱导多能性干细胞(iPS细胞)。

    该研究成果揭示了microRNA通过序列互补调控mRNA 甲基化修饰形成这一全新的作用机制，以及m6A修饰在促进体细胞重编程为多能性干细胞中的重要作用，在解析m6A修饰形成的位点选择机制、拓展microRNA的新功能和发现新的细胞重编程调控因素方面均取得了开创性的重要突破。

　　该研究结果于2月12日在线发表在Cell Stem Cell 杂志。王秀杰课题组的研究生陈同，杨运桂课题组的研究生郝亚娟、李苗苗和周琪课题组助理研究员张映博士为该论文的共同第一作者。论文的共同通讯作者、“干细胞与再生医学”先导专项的首席科学家周琪研究员说，先导专项的实施为来自不同研究所具有各自特长的研究人员提供了更加顺畅的合作平台，对促进这一成果的取得起到了非常重要的作用。

原文摘要：

m6A RNA Methylation Is Regulated by MicroRNAs and Promotes Reprogramming to Pluripotency

N6-methyladenosine (m6A) has been recently identified as a conserved epitranscriptomic modification of eukaryotic mRNAs, but its features, regulatory mechanisms, and functions in cell reprogramming are largely unknown. Here, we report m6A modification profiles in the mRNA transcriptomes of four cell types with different degrees of pluripotency. Comparative analysis reveals several features of m6A, especially gene- and cell-type-specific m6A mRNA modifications. We also show that microRNAs (miRNAs) regulate m6A modification via a sequence pairing mechanism. Manipulation of miRNA expression or sequences alters m6A modification levels through modulating the binding of METTL3 methyltransferase to mRNAs containing miRNA targeting sites. Increased m6A abundance promotes the reprogramming of mouse embryonic fibroblasts (MEFs) to pluripotent stem cells; conversely, reduced m6A levels impede reprogramming. Our results therefore uncover a role for miRNAs in regulating m6A formation of mRNAs and provide a foundation for future functional studies of m6A modification in cell reprogramming.