第二军医大学Hepatology解析癌症相关lncRNA

　　

生物通报道  来自第二军医大学的研究人员通过系统的基因组筛查确定了长链非编码RNA PRAL在肝癌中发生了与疾病结局相关的局部丢失。该研究成果刊登在国际权威杂志Hepatology（影响因子11.665）。

第二军医大学的孙树汉(Shuhan Sun)教授是这篇论文的通讯作者。孙教授的主要研究方向为分子遗传学研究，近年来共发表科研论文210余篇，其中SCI收录论文80余篇。周传传（Chuan-chuan Zhou）是这篇论文的第一作者（延伸阅读：第二军医大学Hepatology发表癌症新文章 ）。

肝细胞肝癌（HCC）是最常见的恶性肿瘤之一，在恶性肿瘤中引起的死亡中仅次于胃癌和食道癌，居第三位。肝癌发生的一个最主要的危险因素就是肝炎病毒的传染，在东亚地区，尤其是在中国，乙型肝炎病毒的感染对于肝癌发生至关重要。流行病学调查发现，乙型肝炎病毒感染导致的肝癌具有非常明显的家族聚集性和遗传易感性，说明肝癌发生存在遗传学的改变，从基因组水平探讨肝癌发生的原因和易感机制，对于肝癌临床的早期诊断和雨后的观察都会具有十分重要的意义。

体细胞基因组拷贝数变异(SCNVs)是多种肿瘤，包括肝癌发生的重要事件。之前的研究中，对于拷贝数变异的解析更多的关注于蛋白编码基因，然而蛋白编码基因并不足以充分解释肿瘤发生过程中的拷贝数变异事件。在很多的高频拷贝数变异区段，并不能用已经发现的蛋白编码基因的功能来解释变异区段和肿瘤发生的关系，也有很多变异区段位于编码基因的荒漠地带，这些现象表明应将拷贝数变异与非编码转录产物联系起来，进行非编码RNA在肝癌中的拷贝数变异研究。

长链非编码RNA(lncRNA)是一类转录本长度大于200nt的非编码RNA产物，虽然不编码表达蛋白，但能够在转录、转录后和染色体修饰等多个层面，调控胚胎发育、细胞增殖、转移和分化等各种生命活动，其异常表达于多种肿瘤的发生发展密切相关。近年来关于lncRNA与肝癌关系的研究已经成为肝癌研究的新热点。因此探讨拷贝数变异是否通过调控lncRNA影响了肝癌的发生发展显得尤为重要。

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在这篇文章中，研究人员通过在肝癌中综合分析具有SCNVs的lncRNA表达谱，鉴别出了染色体17p13.1上lncRNA-PRAL（p53调控相关lncRNA）频发缺失，它的基因组改变与HCC患者生存率下降显著相关。他们发现在体内外lncRNA-PRAL可通过p53抑制HCC生长并诱导凋亡。随后的调查结果表明，lncRNA-PRAL 5'末端的3个茎环模体促进了HSP90与p53结合，由此竞争性抑制了MDM2依赖性的p53泛素化，提高了p53稳定性。此外，在体内传递lncRNA-PRAL可有效减少内在肿瘤，表明了它的潜在治疗应用。

这些研究结果证实了一个关键的癌症驱动SCNVs——lncRNA-PRAL是HCC生长一个至关重要的刺激物，或许可作为抗肿瘤治疗一个潜在的靶点。

（生物通：何嫱）

生物通推荐原文摘要：

Systemic genome screening identified the outcome associated focal loss of long noncoding RNA PRAL in hepatocellular carcinoma

Systemic analyses using large-scale genomic profiles have successfully identified cancer-driving somatic copy number variations (SCNVs) loci. However, functions of vast focal SCNVs in ‘‘protein-coding gene desert'' regions were largely unknown……

作者简介：

孙树汉

男，主任医师，教授，1953年6月生，医学博士，博士生导师，专业技术二级，文职一级。现任第二军医大学遗传学国家重点学科、基础部医学遗传学教研室主任，全军医学遗传学重点实验室主任、遗传研究所所长，第二军医大学“211”工程重点建设学科医学遗传学教研室主任、党支部书记；2000年被评为总后科技银星，2001年被评为军队育才奖银奖，2002年荣立三等功一次，集体三等功一次，2003年被评为上海市抗击非典先进个人，享受国务院政府特殊津贴。孙树汉教授目前兼任：全国农业转基因生物技术标准化委员会委员、上海生物工程学会副理事长、中国生物工程学会理事、上海医学遗传学专科委员会副主任委员、总后医科会委员、第二军医大学生物技术专业委员会副主任、军队药品评审专家、上海市交通大学BIO-X中心顾问委员会委员、第二军医大学高职评审委员、第二军医大学学报编委等职。

主要研究方向为分子遗传学研究，近年来共发表科研论文210余篇（其中SCI收录论文80余篇），论文见诸于 Hepatology、J Hepatol、Cancer Res、J Proteome Res、Mol Immunol、 Int J Biochem Cell Biol、J Gene Med、Clin Genet、Vaccine、Biochem Biophys Res Commun 等杂志。自“九五”以来，先后承担了国家“973”、“863”、自然科学基金重点项目、面上项目等课题共30余项，以及多项校企联合研究项目。申请专利14项，获得授权8项，实现科研转让3项。获得国家科技进步二等奖1项、省部级科技进步二等奖4项、三等奖2项。