浙江农科院：初探豌豆种子发育的调控网络

　　

了解调控豌豆种子发育过程的分子机制，对豌豆育种有着极为重要的作用。为此，浙江省农业科学院蔬菜研究所龚亚明研究员领衔的团队，对调控豌豆种子发育和营养累积的基因和基因网络进行了深入研究，相关成果发表在11月的Frontiers in Plant Science。

在这项研究中，研究人员使用转录组测序和生物信息学分析考察了菜豌豆和粒豌豆种子发育过程中基因表达的变化，并比较了这两种类型豌豆的基因表达谱（转录组测序分析由联川生物协助完成）。转录组测序共产生18.7G原始数据，从头组装获得了77,273条平均长度930 bp的unigenes。实验数据表明，豌豆种子发育的转录调控是一个高度协调的过程。实验发现，分别有459和801个基因在菜豌豆和粒豌豆种子成熟早期和晚期出现差异表达。其中，可溶性糖和淀粉代谢相关基因在豌豆种子发育中被显著激活，这与种子中启动糖和淀粉积累是一致的。比较分析菜豌豆（高种子可溶性糖和低淀粉）和粒豌豆（高种子淀粉和低可溶性糖）中参与糖和淀粉生物合成的基因发现，在种子发育晚期，这些基因出现差异表达，会导致菜豌豆和粒豌豆中可溶性糖和淀粉生物合成量之间呈现负相关。研究人员从转录组测序数据中随机选取30个基因对测序数据的可靠性进行了qRT-PCR验证。

此项研究首次报道了豌豆种子发育的转录组。上述研究结果将为未来揭开控制豌豆种子发育生物学的潜在机制打下基础，并作为改善豌豆育种的有益资源。

参考文献：
Liu N, et al. (2015) Comparative Transcriptomic Analyses of Vegetable and Grain Pea (Pisum sativum L.) Seed Development. Frontiers in Plant Science. 6:1039. doi:10.3389/fpls.2015.01039

联川生物为研究人员提供从转录组鉴定到表达谱分析的一站式解决方案

获取更多用户研究案例，请访问www.lc-bio.com或拨打免费咨询热线800-857-1452。

关于联川生物
联川生物成立于2006年，经过多年的快速发展，已成为业界领先的多组学技术服务商。公司拥有具有自主知识产权的µParaflo®微流体定制化芯片平台，可以为科研用户提供从基因组，转录组，到蛋白组的高通量定制化表达谱芯片解决方案。我们是全球首家提供microRNA表达谱芯片分析的服务商。作为国内最早提供高通量测序技术服务的公司之一，联川生物拥有经验丰富的技术团队和一流的生物信息学专家组，可以为研究人员提供多组学测序服务和深度个性化数据分析解决方案。为满足研究人员跨组学高通量研究需求，联川生物已将蛋白质组定量分析引入技术服务线，为用户提供贯穿中心法则的全程解决方案。多年来，联川生物一直与国内的科研团队保持着长期紧密的合作，助力科研人员在生物、医学、和农林领域的科学发现。全球科研用户使用联川生物的优质科研服务和高质量组学实验数据已发表了逾600篇高水平研究论文，其中已在Cell，Nature，Science系列顶级期刊上发表论文22篇。