中山大学Nature子刊发布癌症研究新成果

　　

生物通报道  来自中山大学、德克萨斯大学西南医学中心等处的研究人员报告称，他们开发出了一种基于CpG甲基化的检测方法来预测肾透明细胞癌（ccRCC）的生存。这一重要的研究结果发布在10月30日的《自然通讯》（Nature Communications）杂志上。

中山大学附属第一医院的罗俊航（Jun-Hang Luo）研究员是这篇论文的通讯作者。长期从事泌尿外科临床工作，擅长于肾肿瘤、膀胱肿瘤、前列腺肿瘤、肾上腺肿瘤、泌尿系统结石、前列腺增生等泌尿系统疾病的诊断和治疗。

肾细胞癌(RCC)是最常见的肾脏恶性肿瘤，占所有人类恶性肿瘤的2–3%。肾透明细胞癌是RCC主要的组织学亚型，占RCC病例的80–90%（延伸阅读：Nature：踩下癌细胞生长的刹车 ）。TNM分期和Fuhrman分级仍然是预测ccRCC患者临床预后最常用的预测指标。诸如梅奥医学中心的SSIGN (阶段,尺寸,分级和坏死)评分，及加州大学整合分期系统等临床整合系统可以提高预测的准确性。然而，一些具有相似临床特征或整合系统评分的患者却可能具有不同的结局。因此，有必要为当前的分期系统添加一些可通过已验证的生物标记物获得的预测值。尽管已开展了大量的研究，然而迄今为止尚未找到可靠的预后生物标记物常规应用于临床实践。

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由于DNA甲基化是癌症形成至关重要的一个因素，其作为诊断及预后的一种生物标记物迅速获得了临床关注。DNA甲基化几乎只发生于哺乳动物5′-CpG-3′序列胞嘧啶C-5位置。随着全基因组技术的不断发展，了解与RCC等人类癌症相关的CpG甲基化将会迅速得到提高。

在这篇文章中研究人员报告称，他们开发出了一种基于全基因组CpG甲基化图谱分析的可靠实用的分类器，可利用福尔马林固定、石蜡包埋的样品来预测ccRCC预后。他们在来自中国、美国和癌症基因组图谱数据集等3个独立的数据集中验证了这一分类器。这一分类器独立于临床标准预后因子，预测出了ccRCC患者的总存活率，其成功地将患者分为了高危和低危群体。此外，研究人员还调查了CpG甲基化与基因表达之间的关系，分析了基因相互作用网络。

研究结果证实，新开发的分类器是一种实用、可靠的ccRCC预测工具，可为分期系统添加预后的预测值。

作者简介：

罗俊航

男，研究员，硕士生导师，博士。广东省医学会泌尿外科分会微创学组成员，中国抗癌协会癌转移组青年委员。长期从事泌尿外科临床工作，擅长于肾肿瘤、膀胱肿瘤、前列腺肿瘤、肾上腺肿瘤、泌尿系统结石、前列腺增生等泌尿系统疾病的诊断和治疗。已在《Urology》、 《World journal of Urology》、 《Journal of Andrology》、 《Andrologia》等国际知名的泌尿外科和男科杂志发表多篇关于腹腔镜治疗泌尿系统疾病和男科疾病的学术论文。发表泌尿外科论文50余篇，其中被《International Journal of Cancer》、《Cancer Science》、 《Cancer Epidemiol Biomarkers Prev》等SCI期刊收录的论文十余篇。编著《膀胱癌》、《泌尿外科疾病临床诊断与治疗方案》、《男科手术学》等学术专著5部。2010年入选中山一院优秀青年人才培养计划。

（生物通：何嫱）

生物通推荐原文摘要：

A CpG-methylation-based assay to predict survival in clear cell renal cell carcinoma

Clear cell renal cell carcinomas (ccRCCs) display divergent clinical behaviours. Molecular markers might improve risk stratification of ccRCC. Here we use, based on genome-wide CpG methylation profiling, a LASSO model to develop a five-CpG-based assay for ccRCC prognosis that can be used with formalin-fixed paraffin-embedded specimens. The five-CpG-based classifier was validated in three independent sets from China, United States and the Cancer Genome Atlas data set. The classifier predicts the overall survival of ccRCC patients (hazard ratio=2.96−4.82; P=3.9 × 10−6−2.2 × 10−9), independent of standard clinical prognostic factors. The five-CpG-based classifier successfully categorizes patients into high-risk and low-risk groups, with significant differences of clinical outcome in respective clinical stages and individual ‘stage, size, grade and necrosis’ scores. Moreover, methylation at the five CpGs correlates with expression of five genes: PITX1, FOXE3, TWF2, EHBP1L1 and RIN1. Our five-CpG-based classifier is a practical and reliable prognostic tool for ccRCC that can add prognostic value to the staging system.