中国科学家PNAS发布重要基因组草图

【字体: 时间:2015年10月14日 来源:生物通

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  北京农学院、中科院遗传与发育生物学研究所、华大基因等机构的研究团队通过全基因组鸟枪测序,获得了高质量的小豆基因组草图。这项研究发表在十月十三日的美国国家科学院院刊PNAS杂志上,为理解小豆特性及其驯化过程提供了宝贵的线索。

  

生物通报道:小豆(Vigna angularis)是一种重要的豆类作物,在全球三十多个国家都有种植。小豆种子是人类的重要食物来源,能为人体提供淀粉、可消化蛋白、矿物元素和维生素。

北京农学院、中科院遗传与发育生物学研究所、华大基因等机构的研究团队通过全基因组鸟枪测序,获得了高质量的小豆基因组草图。这项研究发表在十月十三日的美国国家科学院院刊PNAS杂志上,为理解小豆特性及其驯化过程提供了宝贵的线索。文章的通讯作者是北京农学院的万平教授、中科院遗传与发育生物学研究所的凌宏清研究员、华大基因BGI的王俊以及印度国际半干旱热带作物研究所的Rajeev K. Varshney。(延伸阅读:华大基因领衔发表Science重大成果

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高蛋白、低脂肪的特性使小豆备受欢迎,但人们并不清楚这些特性的遗传学基础。研究人员比较分析了小豆和大豆的基因组和转录组,发现它们的淀粉和脂肪含量差异是转录丰度造成的,并不涉及相关基因的拷贝数变异。此外,研究人员还对小豆的11个野生品种、11个半野生品种、17个地方品种和11个改良品种进行了种群分析,鉴定了驯化过程中的强选择信号。

这项研究不仅有助于进一步理解豆科植物的进化和代谢,还能帮助人们鉴定关键性基因加速小豆品种的改良。

作者简介:

万平,博士后,教授,硕导,北京农学院小豆研究团队负责人。世界豆类学会(International Legume Scoiety)学术委员会委员(Scientific Committee Member),国际豆类期刊Legume Perspectives编委。2000年,在南京农业大学获农学博士学位。2000-2002,中科院遗传与发育生物学研究所博士后。2011年,在日本National Institute of Agrobiological Sciences进行合作研究。2009年,到英国Harper Adams University做访问学者。

凌宏清 男,博士,研究员,博士生导师。1982年获四川农业大学农学院学士, 1988年获德国基尔市Christian-Albrechts大学农学院农学硕士学位, 1993年获德国基尔市 Christian-Albrechts大学理学院理学博士。19932月至19984月,德国植物遗传与栽培作物研究所(IPK-Gatersleben)从事博士后研究,19985月至20017月,瑞士苏黎市大学植物生物学所研究助理,从事小麦叶锈病抗病基因的克隆。2000年入选中国科学院国外引进杰出人才"****"2001年回国,中国科学院遗传与发育生物学研究所研究员,课题组长。2002年获"国家杰出青年基金"资助。2004年入选国家7部委(人事部、科学技术部、教育部、财政部、国家发展和改革委员会、国家自然科学基金委员会、中国科学技术协会)"新世纪百千万人才工程"国家级人选。2006年获政府特殊津贴。200610月至今,任植物细胞与染色体工程国家重点实验室主任。

 

生物通编辑:叶予

生物通推荐原文:

Genome sequencing of adzuki bean (Vigna angularis) provides insight into high starch and low fat accumulation and domestication

 

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