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何川教授Cell Res发表表观遗传学新成果
【字体: 大 中 小 】 时间:2015年01月21日 来源:生物通
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日前,芝加哥大学的何川(Chuan He)教授领导研究团队,为人们揭示了全基因组范围上的DNA去甲基化动态。这项研究发表在一月十九日的Cell Research杂志上。
生物通报道:DNA甲基化是一种非常重要的表观遗传学修饰,广泛参与了细胞对基因表达的控制。在哺乳动物的早期胚胎发育阶段,基因组DNA会发生大规模的主动去甲基化。但去甲基化的分子机制一直是表观遗传领域的一大谜题。
日前,芝加哥大学的何川(Chuan He)教授领导研究团队,为人们揭示了全基因组范围上的DNA去甲基化动态。这项研究发表在一月十九日的Cell Research杂志上。
近几年,科学家们的研究重心逐渐从4种基本碱基转移到其他经过修饰的碱基,从5-甲基胞嘧啶(5mC)、5-羟甲基胞嘧啶(5hmC)、5-甲酰基胞嘧啶(5fC)到5-羧基胞嘧啶(5caC)。这四种经过修饰的碱基也被称为“新四大碱基”。
5mC是哺乳动物基因组中最常见的一种表观遗传学修饰。这种修饰由DNA甲基转移酶催化,能影响基因表达、基因组印迹、转座因子抑制和X染色体失活,与生长、发育和多种疾病有关。(延伸阅读:何川、任兵、徐国良Cell子刊发表表观遗传学新成果)
TET家族的双加氧酶能够将哺乳动物基因组中的5-甲基胞嘧啶(5mC)逐步氧化成5-羟甲基胞嘧啶(5hmC)、5-甲酰基胞嘧啶(5fC)和5-羧基胞嘧啶(5caC)。哺乳动物的胸腺嘧啶糖苷酶(TDG)负责选择性识别和切除5fC和5caC,通过碱基切除修复使其恢复为普通胞嘧啶。
人们一般认为,转变为5fC和5caC意味着这个经过修饰的胞嘧啶碱基将会被去甲基化。可以说,5fC和5caC代表了哺乳动物基因组中的去甲基化活动。何川等人在全基因组范围上绘制了单碱基分辨率的5fC和5caC图谱,并在此基础上全面分析了基因组的去甲基化动态。
芝加哥大学的何川(Chuan He)教授主要从事化学生物学、核酸化学和生物学、遗传学等方面的研究。近年来在甲基化修饰,尤其是5hmC和m6A等方面获得了许多重要的发现。迄今已在Nature,Science等国际权威学术期刊发表了大量论文。曾荣获美国癌症研究青年科学家奖,凯克基金会医学研究杰出青年学者奖等多个奖项,并当选为顶级生命医学研究院HHMI研究员。
生物通编辑:叶予
生物通推荐原文:Base-resolution maps of 5-formylcytosine and 5-carboxylcytosine reveal genome-wide DNA demethylation dynamics