Nucleic Acids Research发布最全面的microRNA数据库

　　

生物通报道：基因是蛋白质的蓝图，而microRNA可以帮助细胞决定是否要根据这些蓝图制造蛋白。研究者们常常会面临这样的问题：某个与疾病有关的基因受到哪些microRNA的调控？或者，患者体内发现的某种microRNA负责调控什么基因？这些问题的答案，可以帮助医生和研究者们操纵机体中的致病蛋白水平（尤其是癌症）。

日前，美国科罗拉多大学癌症中心在Nucleic Acids Research杂志上发布了一个被称为multiMiR的数据库，这个目前最全面的数据库广泛收集了microRNA及其作用靶标的信息。

“数据库multiMiR可以让研究者们有效搜索，与疾病有关的microRNA-基因配对关系，”文章的一位资深作者，科罗拉多大学的副教授Katerina Kechris介绍道。

除了为人们展示microRNA与其作用靶标之间的关系，该数据库还涵盖了能够影响microRNA的已知药物，列出了与microRNA有关的各种疾病。

“现在，研究者们可以在这一数据库中寻找线索，为包括癌症在内的各种疾病开发新的治疗方式，”文章的另一位资深作者，科罗拉多大学的Dan Theodorescu教授说。

据称multiMiR数据库整合了14个现存的microRNA数据库，并且关联了与这些microRNA有关的研究结果，允许研究者们进行更加灵活的数据分析。（延伸阅读：Biotechniques盘点癌症中的microRNA）

在使用这一数据库时，用户可以输入microRNA、基因、药物、疾病的名称，或者它们的任意组合。举例来说，multiMiR数据库可以根据用户输入的microRNA，搜索已验证或预测性的作用靶标。也可以根据用户指定的基因，给出已验证或预测性的调控microRNA。对于特定疾病和药物来说也是一样，该数据库可以告诉你哪些疾病和药物与你的microRNA有关。

这篇文章举出了一些数据库的应用案例，包括分析microRNA对小鼠自发饮酒的潜在影响，研究慢性阻塞性肺病相关信号通路中的候选基因，以及能够影响膀胱癌的microRNA：基因互作。

“我们需要通过更好的途径来分析已经获得的数据，不然就会迷失在信息的汪洋大海里，” Theodorescu说。“这项研究中的新工具能够为研究者们提供更有意义的结果，最终帮助人们开发出新的疾病治疗策略。”

 

生物通编辑：叶予

生物通推荐原文：

The multiMiR R package and database: integration of microRNA-target interactions along with their disease and drug associations. Nucleic Acids Research