GWAS研究发现新的胰腺癌遗传风险标记

【字体: 时间:2014年08月05日 来源:生物通

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  来自美国Dana-Farber癌症研究所的科学家们报道,对胰腺癌患者和非胰腺癌患者的一项大型DNA分析,发现了几个新的遗传标记,可指示这种高度致命疾病的患病升高风险。相关研究结果发表在2014年8月3日的《自然遗传》(Nature Genetics)杂志。

  

生物通报道:来自美国Dana-Farber癌症研究所的科学家们报道,对胰腺癌患者和非胰腺癌患者的一项大型DNA分析,发现了几个新的遗传标记,可指示这种高度致命疾病的患病升高风险。

这些标记是沿着染色体的特定位置的遗传DNA编码中的变异。研究人员发现,DNA编码中的几个这些变异可影响一个人患胰腺癌的风险。

相关研究结果发表在2014年8月3日的《自然遗传》(Nature Genetics)杂志,本文第一作者Brian Wolpin称,这些标记的发现,连同以前发现的四个标记,都非常的重要,有几个原因,一是,对这些DNA变异的进一步研究,可能有助于在分子水平上解释“为什么有些人比一般人对胰腺癌更敏感或更不敏感?”。第二是,它们有潜力确定具有增高风险的人,然后对这些人进行MRI或超声扫描,以寻找早期的、可治愈的胰腺肿瘤。

Wolpin称:“目前还没有针对胰腺癌的人口筛查项目,有80%的胰腺癌病例被发现时,已经太晚,因此不能进行根治性手术,因为癌症已经扩散。”

目前胰腺癌筛查的唯一健康者是高风险家庭成员,因为这些家庭的多个家庭成员患有胰腺癌。Wolpin称:“但是该领域一直都在努力寻找一些因素,当不存在强大家族史的时候,可根据这些因素在一般人群中确定风险最高的人。”

这项研究分析了来自7,683名胰腺癌患者和14,397名非胰腺癌对照者的DNA,他们都是欧洲血统,来自美国、欧洲、加拿大和澳大利亚。科学家们利用测序技术检测了700,000多个基因组位点,这些位点已知有单核苷酸多态性(SNPs)。这些变异能改变一个基因的表达,或者其信息的内容,研究人员试图寻找与胰腺癌发病风险相关的基因。这种类型的研究被称为全基因组关联研究(GWAS)。

Wolpin称,结果确证,存在四个风险相关的SNPs,在以前更小的GWAS研究中,这几个SNP已被鉴定过。此外,研究人员发现了五个新的风险标志物,具有临界统计学意义。

每个SNP或标记相关的风险在很大程度上是独立的和附加的,所以未来它们可用以试图找出普通人群中的胰腺癌高风险个体。胰腺癌风险的平均罹患风险是1.5%。

长期的目标是,建立一种“风险分层工具”,可用于初级治疗实践,以确定谁应该接受胰腺癌筛选检测,如超声波或MRI。

(生物通:王英)

延伸阅读:《Cancer Research》:胰腺癌治疗的新突破

生物通推荐原文摘要:
Genome-wide association study identifies multiple susceptibility loci for pancreatic cancer
Abstract:We performed a multistage genome-wide association study including 7,683 individuals with pancreatic cancer and 14,397 controls of European descent. Four new loci reached genome-wide significance: rs6971499 at 7q32.3 (LINC-PINT, per-allele odds ratio (OR) = 0.79, 95% confidence interval (CI) 0.74–0.84, P = 3.0 × 10−12), rs7190458 at 16q23.1 (BCAR1/CTRB1/CTRB2, OR = 1.46, 95% CI 1.30–1.65, P = 1.1 × 10−10), rs9581943 at 13q12.2 (PDX1, OR = 1.15, 95% CI 1.10–1.20, P = 2.4 × 10−9) and rs16986825 at 22q12.1 (ZNRF3, OR = 1.18, 95% CI 1.12–1.25, P = 1.2 × 10−8). We identified an independent signal in exon 2 of TERT at the established region 5p15.33 (rs2736098, OR = 0.80, 95% CI 0.76–0.85, P = 9.8 × 10−14). We also identified a locus at 8q24.21 (rs1561927, P = 1.3 × 10−7) that approached genome-wide significance located 455 kb telomeric of PVT1. Our study identified multiple new susceptibility alleles for pancreatic cancer that are worthy of follow-up studies.

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